Example of an OGMP Masterfile

;; Allomyces macrogynus mitochondrial DNA, complete genome
;;
;; this sequence has been published
;;
> A. macrogynus, starts at Eco site before rnl, 57473 Residues.
;      G-citation_6 ==> start /citation=Paquin_6
     1  GAATTCTATATAAATAAGTATTAAATTCTGGTTAAAATATAGAAAAAATAGAATTAGATT
    61  CAATGATATCTAAT
;      G-rnl ==> start ;; this is a gene annotation. 
;;      Gene rnl starts here and continues in the direction of the arrow
;      G-rnl-E1 ==> start
    75  AACATACCAAGGAGTAAAGGACTAATTGAGGATGACTAGTCATTCTATAATTGGAAGCAC
   135  GAATGAGGCTAAAAGAATGATAGTATGTTGTTCGATTCCAAAGGTGAAAACCAAAGACGG
   195  AGAATTCTTATGGAGTCCTGTCTATTTTTATTAACCCTGTGAATTGAAACATCTTAGTAA
;        am1234gsi5 ==> ;(1.2) ;; this is a reading annotation
;;       sequence of clone 1234/universal primer, starts here and 
;;       continues in the direction of the arrow.  
;;       GTP reaction, standard migration, from film i5; insert size ins 1.2 kbp
   255  CAGGAGGAAAAGAAATCAACCGAGATTTTAACGAGTAGTGGCGAGCGAAAGTAAATGAAA
   315  ACATTCATGTTTTGATCCGAAATATCTTATCGATGTTTCGATTTTTTCAAAGACCCCGTA
   375  CCGGGTCTTGGGGCATGTCTGAAATTGAACATCACACACTTACCCATGATAAAGGAGATG
   435  GTTTGGATCTTCGATTCTACCATTTTCAGGCAGTGTGTTTATGGAATGGGTGGCCAAAGA
   495  AGGTGAAAGTCCTGTAAATTTCAGTAGTAGACCACTTATGGAGTAGAACGAATTTTGTTC
;        T-am2345 (0.9) <==* ;; this is a track annotation
;;       sequence of clone2345/universal primer, starts here and
;;       continues in the direction of the arrow. No complete reaction 
;;       has been done, i.e., no reading exists.
   555  AGAAGAAAGGGGTACCATCCTCTAATAAATTAAATATGATAGAATGAACGATAGTGAAGA
   615  GTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTACCTCTAAGAGAACGAAGCCTTCCGAGGCTTCGAA
   675  TATCAATGCCGGAGGGGTGAAATAGATCCTGAATCAGTTAAGTCTAAAAGCAGTTTGAGC
   735  CAAGATTATGGTGAAGACGTACCTTTTGCATAATGGGTCAGCAAGTTAATTTTTGGAGCA
   795  AGAGAACAAAAGAACGTATCTTTGGTACGTTGGTGATCTAAGTGAAAACAAAAGAACAAA
   855  GTGAGACTTAGTCTTACCCCTATACATAATTTTGCACTCAGTGTGATTGATGATCTGGGT
   915  GTTCTGTGAAGTTCCAGAAATTAGACCCGAAACCAAGTGATCTATCCATGGCCAGGTGTA
   975  AGACCGAACGGGTGATCGTAGTAATGCTCTCCGATGAGCTTTGGATAGCCGTGAAATGCG
  1035  AATCGAACTTGGAAATAGCTGGTATACCGCGAAAACTATTGAAGTAGAACGCTAAACCTA
  1095  CAAACGAGGGTACAGCACTGGAAGAAAATTCTAAACTGGAAATATCGTTGACTTCATATG
  1155  AGTCCTGAGACCCCCCTCCGGGGGGGTTTACATTTTTAGGTTTAGTAGTCAGATTATCTG
  1215  TGATAAGGTAGTTAATCAAAAGGGAAACAGCCCAGACCAAAAGTTAAGGTCTCAAATGAT
  1275  TACTAAGTGAAATTAACCGAAAACAAAGCGACAAGCCCGAAAAAAATCACATAGATATAT
  1335  ATCTTCATGTGGGTAGAGGGAAATGATGGTTTTACTATCATGAGTCGAGACAATCACTTT
  1395  GTGGGCTTGGAAGCAGCCATCAATTAGAGAAAGCGTTACAGCTCAATGATCGAGAAAGAA
  1455  ACCCATCAGGGTTCTCATATATGATTTTGTTTCTCGGGAAAATGTATCGGGTCAGACTCT
  1515  TATCGGCCTCAGTAACCGAATTGAAAAGAGTTGGGGGTATACCTTTGGTGGCTCTGCCCC
  1575  TTTAAGTAATCAACCGAAACTTTGGCAAGCATGATGTGAGACATGGTAACGTGACTTATC
  1635  ATTATGTTTGGGTAGCGGTACATTCAATTGATGGAGTGAAGGGAAAACGAGAGTTTTTCT
  1695  GGAATGGATTTGAAGAGAGAATGCTGACATGAGTAACTAAAAAGGAAAAAAAATCCTTCC
  1755  CCTAAAATTCAAGGGTAAAAAATAATCGGTTTCTAAGTCGAGACACAACTGTGTTTGACG
  1815  ATGAAGAGGAACGAATCTGATTTCGTTCTGATTTATAACCGTACCTTCCAACGCTGGAGA
  1875  ATGAGCTGGTAAACAGTGAAGGGGAATGGGAGAACCATCTTGAAGGAACTAGGCAAAATG
  1935  ACTCTGTAACTTCGGGAGAAGGAGGAGAAGAATGAAAGTGACATTGGTCATTGAAAGAG
;      G-rnl-E1-Mob-DHE1 ==> start
  1994  AAGATACTTCGTATCTTGTCCAAACCCCGTTGGGGTTTCGAT
;      G-rnl-E1-Mob-DHE1 ==> end
  2036  TTCTTCTAAAAAAATAGAGAGGGGCAACTGTTTACTAAAAACACAGGAGTCAGCAACCCC
  2096  GTAAGGGTTAGTATTGGCTCTGAAGTCTGTCCGGTGCAAGTAAGTGAAAGATGAAAGAAA
  2156  GAGATG
;      G-rnl-E1-Mob-DHE2 ==> start
  2162  AAGGACCCCGGCCCGAAGGGCCGGGGGACTTGATCCAAAAAGTCCGCCCCTTCGGGGCGT
  2222  TCCTTTTTCGATT
;      G-rnl-E1-Mob-DHE2 ==> end
  2235  TTTTTCTCATAACCTCTTGTAAACGACGGCCTTAACCATAAGGGTCCTAAGGTAGCGAAA
  2295  TTCCTAGGCTAATAATTGTAGTCCTGCATGAATGGCGTAATGATCCCTCTACTTTCTACA
  2355  AGATGGACCCAGTGAAATTGAATTATCCGTGCAGATGCGGATTACCATTAGCCAGACGAG
  2415  A
;      G-rnl-E1 ==> end
;      G-rnl-I1 ==> start /group=IIB1
  2416  GTGCGACCAGCAAAGTGGGGCCCCAACGGGACCGACCCCCCTCCGGGGGGGCCGTTATAA
  2476  AATGTAATGCGGTGAAACCCCGCCTGGATGTCTATCTCCTGAGTTCAAGACAGTATGCAT
  2536  TATTGGTAACGATTTTGTATAAAGCCTGTCTTTAAAACCAGAAAATAATGTAATTCAAGT
  2596  ATTATTTCTCTGTAGAACTAGATCTCTATGGATAACGAAAGTGAACTCACGTTTGAAGCG
  2656  TAGCAGCTATGAAAGGAAATTGAATTGACACCTTTCAATAATGACTAGGATTGAGTGTTC
  2716  TCGTACTTAATTCGGTAGACTTTTTGTCATTCTACGTATAGTGAGATCCTAAGGAGATCA
  2776  TAAAAGTGCATTTTATAAAACTGGGTAAGCCCAATTATCTGTGACAGGATCTTATTCCTT
  2836  TCTCAGGGAGATGAGCAATTATCTCTATCGATAAGTGGGTAAAGGATAGTATAAAAAGCA
  2896  AATGCCACAATGTAATTTTGTGGATAGGGTATCATGCCTAAATCGAAAGATTGCTGACTT
  2956  ATACTTGGTGCTAATACCCTAATTAGGGGGTTCAAATGCCTTAAACTTTTCAAAAAAAAG
  3016  TGAAGAACCCCGAGCGCAGCTCGGGGGACTTTGCCAAAACCCCCCCGAAGGGGGGGGTTT
  3076  TCGTTTTAATTTTTAAAGTTTAAAAATTGAGAACATAAGTGCTTGAGCCGTATGCGATGA
  3136  AAGTTGCACGTACGGTTCTTACCGGGGGAAAGCTTGAGAGAGCCTACCTATCGGAAC
;      G-rnl-I1 ==> end
;      G-rnl-E2 ==> start
  3193  AGACCCTATGAAGCTTTACTGGAATTAAACTTTGTTTCGTTGGTGAACTGAATGTAAAAC
  3253  TTGGTCTTTTTCTTCATTCACCGATAATACGGAAATTATGTTCCTTTAAGTTTAAGTGAC
  3313  AGTTTAACTGGGGAGGTTTCCTGCTAAATAGTAACGAAGGAGTACAAAGGTATAATTGAA
  3373  GTCACTCTGTAATTGACTTGAA
;      G-rnl-E2-Mob-DHE5 ==> start
  3395  GAAAGGTCATATCCTTTCACCCGATTCCTGTAATCGGGT
;      G-rnl-E2-Mob-DHE5 ==> end
  3434  TTAAATTGTGCAATGGCATAAATATGCTTGACTGTAAGACTATTACTCGTCGAACAGGGA
  3494  GGTAACTCGGTCATAGTGATCCCCAAATTCTTTATGGAAAGGTTTGGGCTCAACGGATAA
  3554  AAGCTACTCTAGGGAT
;      G-rnl-E2 ==> end
;      G-rnl-I2 ==> start  /group=I /note="inserted in yeast mt omega site"
  3570  TAACTGCGGTCCCACAAGATCGGAAGGTCTTGTTAAAGGAATCGCCCCCGGAAGGGGGGG
  3630  GTGAGAACGTCTCAGTGAGACGTCATCTATGATTCCCAACTCGTTTTGAGTTGAATCGGG
  3690  TGAATTGTCAAAGACGCTAAGGGGAGAATCGAGATCCCTACGCCAATTTGCAGCGAAGCT
  3750  TGTTTCGGTTTGATGATGATTTTCGGATCTCATTTGGAGCAAGAACGTTCAACGACTAGG
  3810  TGGTGAGTACAACCAACAATAATCCACCCACGAGCGCCCGACAACCATATATATGGTTGA
  3870  TGACATAGTCTGAGCAAATAGGAAACTATTTGGGAGGGGTTTAAATACTCATCCAATAAC
  3930  ATAACTG
;      G-rnl-I2 ==> end
;      G-rnl-E3 ==> start
  3937  AACAGGCTGATCATTCTTTAGAGTTCCTATCGACGGAATGGTTTGGCACCTCGAT
;      G-rnl-E3 ==> end
;      G-rnl-I3 ==> start /group=I
  3992  GAAATGAAGCTCGGCAAAAATCGTGAGATTTTGATGAAAATTGGGTGAATTGTCAAGAAG
  4052  ACTAAGGATAGTTATATAATTCTTCTTCTCATGAGGACCTAAAGGTCTTGATGTACATAA
  4112  ATTATATTGATTATCTATGTTAACTTGCAGCGAAGCTTATTTTTGCATACTAAAGTACGT
  4172  AGTACTCTGGTTTGAAATAAGAACGTTCAACGACTAGGTGGTGAGTAGTGCAAACAATAA
  4232  TCCACCCACGAGCGCCCGACAACTTATTACATTATCCGTTTTAAGTTGATGACATAGTCT
  4292  GAACATGTATGAAAATACATGAAGATTGGGTTAAATTCCTGATCGATAACATATTTG
;      G-rnl-I3 ==> end
;      G-rnl-E4 ==> start
  4349  GTCGGCTCATCGCATCCTGGGGGTGAAGAAGCTCCCAAGGGTTGGACTGTTCGTCCATTA
  4409  AAGCGGT
;      G-rnl-E4 ==> end
;      G-rnl-I4 ==> start  /group=I
  4416  AGAAGTATACGTGCCGCAGAAATTATTGAATGGCCTTCGGCTATTCTCCCCCCTTCTGGG
  4476  GCTATTTCTTAAAAATTCCACTATATGCTGGAAACTCCATGAATAAATAAAAGTACGATA
  4536  TGTTTATTATATCGTTAAAATCTTTTGTTTTGCCGTTGGCATGTGGACAATCAGCAGGAA
  4596  ACTGAAGAACGTGCTCAAGCACGTTCAATACTATTCAGGTTCCTCAGAGACTATATGTGG
  4656  AACTCAGAGTTCATTCATGAACTGAATAAATAAGATGAAAATATAGTCCAAAAACTTTGT
  4716  AATGATTTATATACTCTTTCAGAGTCTTGGTTGTTCAAAGTTTTG
;      G-rnl-I4 ==> end
;      G-rnl-E5 ==> start
  4761  ACGTGAGCTGGGTTTAGAACGATGTAAATCAGTTCGGACTCTATCTACTAATGGGAAGAA
  4821  GGAAGTGACAAGAATAGAATCCTAGTACGCAAGGAATGGATTGTGTGAACCTCTAGTGTA
  4881  CCTGTTGACTCACGCAGAATATGCGTTCTCATCGCAGGGTAGCCACGTTCATAAAAAATA
  4941  AGAGTTGAAAGCATCTAAAACTCGAAGTTGATCTTGAAACTTCTTTAAAACACGCTAGAG
  5001  ACTATAGCGAAATAGGTCATAAGTATGATAACCCGAGAGGGTCGGCTGAATGATACTAAT
  5061  AGTTATTTATCCTTGGTATGTT
;      G-rnl-E5 ==> end
;      G-rnl ==> end
  5083  GATTGTCCTATAAGTATTATCAGGGTCTAAATTAATCTAAATTGTACCCTACATCATAGA
  5143  ATCATATTCCATAAGAGACGAGGCCCGCCCCGGGCCTTGTCCAAACCCCTCAGATGAGGG
  5203  GGGACTTCATTTTTTTTCGGGGTTTCGACTCCATGTGGAATAAAAGAACGTATCTTTGAT
  5263  ACGTTGGTTAATTATAAAATAAGAATAGATATTATCAAGTCTTAAACAATCTTATTGGTA
  5323  AAAGTCCTTGGTAGTGGACCCCCATGAAAGAAGAGACTCCGGCTCTTGTCAGGCGACCTG
  5383  AGGTCACCTTCAGGTACATGAGCTCGGTAACGAGCGAAAACCCCCCGGAGGGGGGTTTAG
  5443  CGAAGAGGCCCCCCGGAGGCGCGCGGGTGAGGGCAGGGGGGGAACTTGGCCAAAACCCCC
  5503  AAAAAATGATATTTTTTTGGGGGGTTTAGCGAGGGCCCGCAGGGCCCTTGCCAAACCCCC
  5563  CCCAAGGGGGGGTTTAGCTCCTCTTTGGGGGTAAATAGGACTCCTCATTTCATTCCTCCG
  5623  GTATATACACCCTCCCATAATATAGACAATACATTGAGTCTCGCGAGACGAGACTCAGAG
  5683  AGTCCCCCTGGGGGCGATGATCGCGGGTCCCGAGATTGTAGCTAGGTATCATTGAAAGCC
  5743  TAAAAAGAAAAGTGAAGAATC
;      G-cob ==> start
;      G-cob-E1 ==> start
  5764  ATGAGATTCTTGAAAAGTCATCCAGTTTTAAGTTTAGCTAATAGTTTTTTAATTGATTCG
  5824  CCATTACCATCAAATATTACTTATTTATGGAATTTTGGTTCATTATTAGGATTATGTTTA
  5884  GTAATTCAAATAGTTACTGGTGTAACTTTGGCAATGCATTATGCACCATCAACATCACTT
  5944  GCGTTTGTTAGTGTTGAACAT
;      G-cob-E1 ==> end
;      G-cob-I1 ==> start    /group=I
  5965  ATATAAAAGGGACCCCCCCCGGGTCCCGCCACCTCACTTCGTGAGGTTGCTTCTCAAATG
  6025  ATGTGTTCATTAAATTCCACTATATGCTGGAAACTCCTAAAGATTAAAGTACCTGTAGGT
  6085  CCCTTTATGGACTGATGTTACAGGTTAAAACCTTTACCGAAATGGCCGCATCGGACCGAA
  6145  GCACCAGAGAGGTGCTTCCAATGGACAATCAGCAGGAAACCAGTGGGTATCTTCACCGGG
  6205  ATCTTCAGAGACTATATGTGGAACGTTCTTATAGAATGGTGACATAGTCCGGAGACAAGT
  6265  GATAGCTTGTCGATTCTTCG
;      G-cob-I1 ==> end
;      G-cob-E2 ==> start
  6285  ATCATGAGAGATGTATTCTATGGTTGGTTAATAAGATATGCACATGCTAACGGTGCTTCA
  6345  TTCTTCTTCATATGTGTTTATATTCATATGGCAAGAGGATTATACTTCAACTCATATACA
  6405  AAACCAAGAGTATTATTATGGTCAGTAGGAGTAGTTATCTACATCCTTATGATGGCTACA
  6465  GCTTTCCTTGGTTACGTATTACCTTGGGGT
;      G-cob-E2 ==> end
;      G-cob-I2 ==> start  /group=I
;      G-cob-I2-orf246 ==> start   /first_codon=Q /OMEGA /inframe /pseudo
;      G-cob-I2-orf246-F1 ==> start /join
  6495  CAAATTATTACAGATGGCCCAATATGTTTATTTGAATCTGCAGTCTTACATCTTGCTACC
  6555  GTACCTTCTTCTCCTGTTAAACGGAGTCGAACTTCTAGAAAAGAAATCCCCGGGTATGAT
  6615  TATGGTTCTGATGATGATTTGATTAGTGTTATTATTGGTTCTTTATTAGGTGACTGTCAT
  6675  GCGGAGTCACGGTCTGGTAATGTACGGTTTACTTTTAAACAAAGTGCTGTTGTGCATAAA
  6735  AGTTATTTGTATTGGTTGCATGAATTCTTTGCTAAACGTGGCTTATGTAATTCATTAGCT
  6795  CCAGACCCCAAACCGTTACTTAATAAGGACACCGGGGAGACGTATTGGTATCTTAAATTC
  6855  AGTACGTATACTTTAGCATCTTTCAATTGGATTTATGATATGTTTTATGTGAATAGGATT
  6915  AAGATTGTACCTAAAAATATTAAGAAATACCTTACACCCTTGGCTATTGCAATATGGATT
  6975  ATGGATGATGGCAGCCGGGCGAATAACGGCGGATTGTTATTACATACGAACAGTTTTTCT
  7035  CAAGAAGATGTTCGATATTTAGGTGATCAGTTAGCTGATAGATATGGCATTTGTTATTCT
  7095  ATTCATGTGAAAAAGGGTGGTAAGGGCAACAAAAGTATTTATTATTTACTTTATATTGAT
  7155  AATGCATCTATGGATATTTTACGGCCACAAGTTAAGCCTCACATGCACCCGGACATGCTT
  7215  TATAAAATA
;      G-cob-I2-orf246-F1 ==> end
;      G-cob-I2-orf246-Mob-DHE7 ==> start
  7224  GCGTCGCCCCGCAGGGGCGATGCGTGTTCCGGTCCTTCGGACCGGGGCCCC
;      G-cob-I2-orf246-Mob-DHE7 ==> end
;      G-cob-I2-orf246-F2 ==> start
  7275  GCTAAGGATTAA
;      G-cob-I2-orf246-F2 ==> end
;      G-cob-I2-orf246 ==> end
  7287  GATTAGTAGATCAATAAACATAGTTCAATTATCTTTACTGCAATCTTAAAAGAAAAAGTA
  7347  AACGACACCGGGTTATACAGGTGTAGATAATTTTGAGCGACACTAGTGAAAACGGTTAAC
  7407  GATATTGTTCTTGGATATTAAAACCGTCGGTTTATACAATCGCTACCGACTGGTTCTCTA
  7467  GTGGGTACCTGAAATGGTGCTTAATGTACAGTCGAAGCATAGGCTGACATATGTCGGTCC
  7527  ACAAGGCCTTTAAGGTACATGGCTAATTACTAATAAGAACAGGGATACTCCCTTAGTAAT
  7587  TAAGATATCAGATAAAGCAGTATTTATGCTCTGGTATCGTGTTTATGCTTG
;      G-cob-I2 ==> end
;      G-cob-E3 ==> start
  7638  CAAATGAGTTTTTGGGGT
;      G-cob-E3 ==> end
;      G-cob-I3 ==> start   /group=I
;      G-cob-I3-orf233 ==> start /first_codon=D /OMEGA /inframe
  7656  GATTTTAGTTGCCCTATATGGTTGGATTTTAGTGTATTAGATTCTTCTTGTTTGCCTATA
  7716  TTACCCTTTAATAAGAGTCATACAAGAGCTATTAAGCGAGTAGGTCCTCATTGTCAAGAT
  7776  ATTCTTAGTATTATATTTGGTAGTTTATTGGGCGATGCCTTTGCTGAATTAAGGAATGGT
  7836  GCTACAAGAATATGTTTTCAACAAGAATCTTCGCATAGAGAATATCTTTTATGGCTTCAT
  7896  CGTAAAATAGCAGATTTAGGTTATTGTAATCCCGATGTACCTGAAGTAGCTAGTAGACCT
  7956  GGTTCATCAGGTAAAACAAGATTCCTGTCTAGGTTTAAAACCTGGTCCTTTACTAGTTTT
  8016  ACATGGATTCATAGCGTTTTTTATGTCAATGGAGTAAAGATTGTTCCAAAATGTATTGAG
  8076  CTTTACTTAACACCTTTGGCTCTTGCAATTTGGATACAAGATGATGGAGGCGCAGTTTCT
  8136  ACTACAATGAAAATCGCCACTAACTCTTTTACTCTTTCTGACATTCAATTTTTATGTGAT
  8196  GTGTTAGATCGATTGTACAATATTAAAGCTACCCCAATGAGCGCAGGGTATCCGGGTCAA
  8256  TATTGTATTTATATCAAGGCGGAATCAATGCAGTTAATTGCTGATATTTGTAAGCCACAC
  8316  ACACATCCTTCTATGTATTACAAATTTAATGGGTATATGTAG
;      G-cob-I3-orf233 ==> end
  8358  TACAATTAATTCAATTATAGTTCACCGTAAATATAGTGTAATTTGTATAAAAAAAACTAT
  8418  TCCCGTTAGGACGCCTTTATGGCATTTGAGTTATTTTGCTCAATTACGGTGGGGCATCCT
  8478  TGCCAGAGGCACTTATTTTCCTCTTGCTACATTAGTGAAAACGGTTAACGAGATTTCTTC
  8538  TATTTCTAGACCGTCGGAGGTATACAACTTCGCTACAGACTGGGACACTAATGGGTGGCT
  8598  GTAATGCTGCTTAATGTACAGTCGGTATTTCCAACAATCTATAGGATATTCCGTCTTTAA
  8658  ATTGTTGACAAGGCCTAGAAGAATCCTGAGATTCTTGGGTACATAAGAATATGGCAGAAG
  8718  GATTTCTTTCAACTCATCCATGATGGGCCACTTAAAGAAATGTTCTTATTCTTGAAATAT
  8778  G
;      G-cob-I3 ==> end
;      G-cob-E4 ==> start
  8779  GCAACTGTAATTACTAACTTATTATCAGCAATACCTTACATTGGTACTGCGTTAGTTGAA
  8839  T
;      G-cob-E4 ==> end
;      G-cob-I4 ==> start  /group=I
  8840  TTGTTTAACAAGTTCCGGAGAATAGTAATATTCTCATGAAAATCGGGTGAATTGTCAAGG
  8900  AGACCTCCTACAATGGAGATGACTTGCAGCGAAGCTTATATCAGTGCTTAATAGATATAA
  8960  GAACGTTCAACGACTAATCGGTGAGTAGCACTAACAATAAACCGGACACTAGGTGGTGAG
  9020  TACAACCAACAATAATCCACCCACGAGCGCCCGACAACCATAATTATGGTTGATGACATA
  9080  GTCTGAACAGGCAGGTGACTGTCTGAAGAGAAATTTAAACGATTTCTCGATAACATAATT
  9140  G
;      G-cob-I4 ==> end
;      G-cob-E5 ==> start
  9141  TTGTTTGGGGTGGATTCAGCGTAGATAATGCAACATTAAACCGATTCTTCAGTTTACACT
  9201  ATTTATTACCATTTATCTTAGCTGCGTTAGTAGTTGTGCACCTTATCGC
;      G-cob-E5 ==> end
;      G-cob-I5 ==> start  /group=I
  9250  TTTCTGTGGAGGGCCTGGGTATTAAAAAATATTACCCTGCATCTTGCTATATGCTGGAAT
  9310  ATTCTAAATATTAAAGTACTAAATATATAGTTTGATAATTTAATTTTTATTGGATTTATT
  9370  TAGTTAAAAGCTTTAATATAAGAGGGTCACTGACACCTTATTTGTGAATAATCAGCAGGA
  9430  AATGATTACATCAGTTCCTCAGAGACTACACGCAAGACAATTTTATTGATGATATAG
;      G-cob-I5-orf242 ==> start  /first_codon=S /OMEGA /pseudo /note="no AUG initiation codon"
;      G-cob-I5-orf242-F1 ==> start  /join
  9487  TCCCTAAGTCAATTAATATTGACGAATGATACGATAATAAAGTTCCATAATTTATCAGGA
  9547  TATTTTTCGTCTAATAGAGCATATACGACTAAGACTAGATTAACTCAATTTGAGAGAGCT
  9607  CAATTTAAGTTAACTCCTTATTTAAAGGAAGTGTTAGTAGGATTAATTTTAGGTGATTTG
  9667  TATATGAGACGACATTCGCCTACTGCAAATGCAAGAC
;      G-cob-I5-orf242-F1 ==> end
;      G-cob-I5-orf242-Mob-DHE8 ==> start
  9704  GAGGCCCGCCCGGAGGGCGGGTCCTTGTCCAAACCCCTCCGGGGTTTCGAC
;      G-cob-I5-orf242-Mob-DHE8 ==> end
;      G-cob-I5-orf242-F2 ==> start
  9755  TTCAATTTAGACAAGGTTTTCTTAACCATGCATATCTATCATATCTTTACAATTTATTTA
  9815  TTGTTTACGTTAAACAAGGAATTTCTTATTCAGTTTTAGGAAGTTGGAGTACACCTAGAA
  9875  ACTTACCTAGAATCTCTGTCTCATTCGCAACTATGGCATTGCCATGTTTCAATTATTATT
  9935  ATGATTTATTTTACAAGAATGGAAAGAAAGTAATTCCTGAAATCATTGGTGAATTATTAA
  9995  CTTTTGTTTCTTTAGCATTCTGGATTATGGATGATGGCCACTATATGGCTAACGGAGGTA
 10055  TTCGACTTTCTACTGATAGTTATACTCACAGAGAAGTTCTTCTTTTACAAAAAGCTATGG
 10115  TGGATAATTTTGGCATTAATCCTACACTTCAACTTAAAGTTAAAAGTAAGGGGCAATATG
 10175  TAATCTATATCCCTAAAGGTGATGTAGATAAAATTAGACCTTTCTTAGTACCGCATATGC
 10235  ATGCTTCTATGATGTATAAATTAGGACTTTAA
;      G-cob-I5-orf242-F2 ==> end
;      G-cob-I5-orf242 ==> end
 10267  GTATAATCTCG
;      G-cob-I5 ==> end
;      G-cob-E6 ==> start
 10278  GCTCCACGAACACGGGTCAAATAACCCATTAGGTATCTCATCAAAAGTTGATAGACTCCC
 10338  CTTCCACCCATACTTCACATATAAAGATTTAGTAGGATTCTTTGTATTCTTCCTTATCTT
 10398  CTTTGGATTCGTATTCTATCAGCCAAATTTAATGGGT
;      G-cob-E6 ==> end
;      G-cob-I6 ==> start /group=I
;      G-cob-I6-orf361 ==> start  /first_codon=H /LAGLIDADG /inframe /pseudo
;      G-cob-I6-orf361-F1 ==> start /join
 10435  CATTGGATGGCTCGTAATAGTTGCGAAATTATTTTATATTTTAGCACTGTATGCTGGGAC
 10495  TTCTTGTTATTGTCTTTATGTACTAAAATAGTAATTGGAACAAATTCTGGTACTTATTTT
 10555  GAAGATATTTTAAAATTTTTATATAGCTTTGAATTTTTTCAAATTATTTTCATCTCTTTA
 10615  ACCTGTCTTGTTGTTTTAGAGGTTGAGTATATAGTTCCTCCTAAGTTCCCTTCTTTAGTA
 10675  AAAACCATAAGACATAGAAAACCTGCAGGAAATATATTAAGTGCCTCAGATGGGCAAAGT
 10735  AATGAGGATGATATTACTGATACAATAAAATATAGCTCCTCCGAGACTACATGTGCTACT
 10795  TTCTATGATAATGATTTTGATCAATTTGGTCATTGGTTAGCAGGTCTTATAGACGGTGAT
 10855  GGGTCAATGTATGTATCAAGTACTGGTCAACCTGAAATTGAAATTACTTTGCATGAAGAA
 10915  GACGTAAAAACTCTTCACAAAATTCAATATATCCTTGGTGTAGGTTCTGTTTCTAAAAGA
 10975  GAAAACACTAAAGCGA
;      G-cob-I6-orf361-F1 ==> end
;      G-cob-I6-orf361-Mob-DHE9 ==> start
 10991  GAGAGCCCCTCGCGAAGCGAGGGGCTCTTTGCCAAAACCCCCGTTGGGGGTTTTCG
;      G-cob-I6-orf361-Mob-DHE9 ==> end
;      G-cob-I6-orf361-F2 ==> start
 11047  CTTATCGATTCAGGGTAAGAGATAAGGCAGGATGTATCCTTATAATTAGCTTAATAAATG
 11107  GTAAGTTGTTAACTCCTGGTAAACACGACCAACTTATTAAAATGTGTGGTGCTCTTGATA
 11167  TTGTGCCAATTACAGATAATACTTTCTCTATAGATAATGCTTGGTTTAGTGGATTCTTCG
 11227  ATGCCGAAGGATATATATCTGTTAGAAACAAGTACACTTTAACATTAAGTGTTAGTCAAA
 11287  AACACAAAGATATTTTGGAACAAATTTGCACTGGGTTTGGTTGTGGTAACATATATTATG
 11347  ATAAAAGCTGGGATGGGTACAACTACGCCATCACTAAAAGAGCTGAA
;      G-cob-I6-orf361-F2 ==> end
;      G-cob-I6-orf361-Mob-DHE10 ==> start
 11394  GGAAAAGCCCGCCCAAAGGGCGGGCTTTTCTTGAGCCCCAACCTCCCGGAGGGAGGTTCG
 11454  AGCT
;      G-cob-I6-orf361-Mob-DHE10 ==> end
;      G-cob-I6-orf361-F3 ==> start
 11458  TCTCACCATATTTTATTGGATTATTTTGCTAAGTTTCCTTTATTGACAGTTAAATATGTA
 11518  GATATAATCACATTTAAACAGTTGTTACATTATGTAGAGTTAGGTTACCATCTTAGTAAA
 11578  AGTCCTTATAAATCAAAAATTGATCATTTATTTACATTATTTAGAAATAGAAAGAAGGTA
 11638  TAG
;      G-cob-I6-orf361-F3 ==> end
;      G-cob-I6-orf361 ==> end
 11641  TCCTTTTAAG
;      G-cob-I6 ==> end
;      G-cob-E7 ==> start
 11651  CATCCCGACAACTACATCCCTGCAAATCCGTTAGTTACGCCTGTATCTATCGTGCCTGAG
 11711  TGGTACTTTTTACCGTTCTATGCCATATTAAGAGCTATACCATCAAAATTAGGTGGTGTA
 11771  ATAGGAATGTTTGGTGCATTATTAATATTACTTGCATTACCATGGTTAGAAACTTCAAAA
 11831  GTAAGAGGAGCAGGATTTAGACCAGTTATGAAATTCTTCTTCTGGTTATTCGTGGTTAAC
 11891  TTCTTCCTTCTTATGTATTGTGGGGGACAACATGCAGAAGAGCCATTTATTACGTTAAGT
 11951  AGAATCTGTACTGCATATTATTTCATGTATTTCTTAGTAATTATCCCAGTAATTGGTCAT
 12011  TTAGAAAATCTTCTTCATAGATGTAGAGACTAA
;      G-cob-E7 ==> end
;      G-cob ==> end
 12044  AGATCAAGTCTGTCTAGGGAATCGATGACCACCTCAAGAGGGGGGTCTCGAGACACCCAT
 12104  GTTTTTCGTCCGTCCAACTCTCCCGGCGGGGCCTTCAGCCCCCCGGGGCGAACAAGAAAA
 12164  ATAAGAGGGACTTAGGTCCCAAAAAAAAATTATTGACAACA
;      G-cox3 ==> start
 12205  ATGACAAAAAAATTAATTAATCAATTCAAATCATTTCAAGTACATCCTTATCATTTAGTT
 12265  GAACCTTCACCTTGGCCATTAGGAGCTTCAGTAGCATGTTTAATACTTACATTAGGTGGG
 12325  GTTATGAAATTTCATGGATTTGCCGCAGGAGACATAGGACTTCCTTTAGGATTAATCTTA
 12385  GTATTAGCTAGTATGCTGTTATGGTGGCGGGATGTGATTCGTGAGGCAACTTACCAAGGA
 12445  CATCATACTAAGACGGTAAAATACGGTATTACGCTTGGCGTAGTTTTATTCATCGTATCT
 12505  GAAATCTTGTTATTCTTCTCACTTTTCTGGGCTTTCTTCCACTCTAGTTTAGCACCTTCA
 12565  GTTGAATTAGGTTCAACATGGCCTCCAGTTGGTATTGAACCATTAAATCCATTTGAAGTA
 12625  CCTTTACTTAATACTATCATCTTGTTAACAAGTGGATGTACAATCACTGTTAGCCATGCA
 12685  AAAATCATTAGTGGAGACAGAGGTGCAACAATACTTTATTTAATCTTAACTATCCTTTTA
 12745  GCATGGATGTTCTTAGGGTTACAATGGGTAGAATATGTTAACGCACCATTCACTATTGCG
 12805  GATTCAGTTTACGGATCTACGTTCTTCGTAGCCACAGGTTTCCACGGGCTTCATGTTATG
 12865  ATCGGTACGATCTTCTTGACGGTTTCATTGAACCGAATCCTTAGTTACCATTTAACATCA
 12925  GGTCATCATCTTGGTTATGAGGCTGCAATATGGTATTGGCACGTAGTTGACGTAATCTGG
 12985  TTATTCTTATACGTGTCTGTGTACTATTGGGGGAGCAACGTATAA
;      G-cox3 ==> end
 13030  TTTGGGGGAGCAACGTAGAATTGCCTAATCGTTTGACCAAATCGGTTGTGACAATTCTCT
 13090  TTGGATTACGGGGTCAGTGTAAATCACTCATACCCCCCCCTCCTCAAAGGACATCGTCCG
 13150  GGTCTGTTTAAATCTTGTCATCCAGTCTTTATTGAGACTGTTCCTTAAGAGCACCGGTCT
 13210  ACGGCGCTGATCTCTACCCCCTCAGCGAATGCTGGGGGGGCCCAAGTAACGTCGATCAAC
 13270  AGGTCTTAGACCTTTTAGAGACAAATAA
;      G-cox2 ==> start
;      G-cox2-E1 ==> start
 13298  ATGAAATTATTAAACTTTATTTACAATGATCACCCTCAACCTTGGCAAATAGGATTCCAA
 13358  GATGGTGCAACAACAACATTTTATGGTATTGTGGACTTACATGACAATATTATTTTCTAC
 13418  TTAATTATTGTTATTATCGGTGTTACTTGGATTCAAACATCAGTAATGCTTGATAGTTAT
 13478  GGTAATTCTGATAAACACGTGTACAAATATAGTCACCATGGTACATTAGTTGAAATTATC
 13538  TGGACTATTACACCTGCTTTAATTTTAGTTGCTATTGCATTCCCATCATTCAAATTATTG
 13598  TATCTTATGGACTCAGTTGTAGATCCGGCAGTAACAGTTAAAGCTATCGGATATCAATGG
 13658  TACTGGGGCTACAATTACGGAGATTACAATGAAGACATCTCTTTCGACAGCTTTATGGTG
 13718  CCGACTGATGAATTAGAAATGGGTCAGTTCAGATTATTAGAAGTTGATAACAGAGTGGTT
 13778  GTACCTGTAGATACTAGAGTTAGAATCGTAGTTACGGCAGCTGATGTTATCCATTCATTC
 13838  GCAGTTCCTTCATTAGGTATCAAAATTGATGCAATTCCTGGGCGAATTAATCAGGCATCA
 13898  TTCTTAATTGACCGAGAAGGTGTGTATTATGGGCAATGTAGCGAACTTTGCGGTGCAAAT
 13958  CACGGAT
;      G-cox2-E1 ==> end
;      G-cox2-I1 ==> start   /group=I
 13965  TAACCAAATAGTCCCTCAAGAGAAGTCTGTACTTCAAACCAACTTGTGTTTCCGCGAGGT
 14025  CTTGTAGAAGGAGTCTTTAAGATTCCCAGACCATAACAGGTCTGAATCGGGTGAATTGTC
 14085  AAGAAGGCTAAGGGAGTATTGTCTCCTATGTTAACTTGCAGCGAAGCTTATATCAGTGCT
 14145  CAACCCTTCTGGGGGGTTTCCGGCTATCTAAGGATCGCGGGGAATAGATATAAGAACGTT
 14205  CAACGACTAATCGGTGAGTAGCACTAACAATAAACCGGACACGAGTGCCCGACAACTTAT
 14265  TACATATTTAGTTTTAAGTTGATGACATAGTCTGAGCAACTAGGAAACTAGTTGAAGTAA
 14325  AGGATAAAGAGCTTTTACGCTAACATAACTG
;      G-cox2-I1 ==> end
;      G-cox2-E2 ==> start
 14356  TTATGCCTATCGCAATCGAAGCAGTGTCACTCGATCGATATGTTGCGTGGGTTGACGCTC
 14416  AATTATCATAG
;      G-cox2-E2 ==> end
;      G-cox2 ==> end
 14427  TACAAGCTATTACTATGGTTTGGGGGTCATGATCCCCCTCCAATAAACACCGAAGAATCG
 14487  AAGCCCGCGTAGCGGGCTTGGATCAATATCGGAACCGCGCGAAGCGCGGTGCCAACATAA
 14547  GCTCGTTACCGAGCTCATGTATTTTATATTTTCATCTTTGATTCTTGGGTCGCGCCACCC
 14607  CGCAGGGGTGGGCCCGAGGAGTCCCAGATATCATAGATATCTTGATGAGGAGAGGGAGGA
 14667  GTCATATATATGACTTCTTCTCCTTCTTTCTATTTAGGACTTCTGGAGCTTCGCTATTAA
 14727  TTATAAAATATGAAAGAGACGAGGCCCGTCCCGGGCCTTGTCCAAACCCCTAATATGACC
 14787  TCACACGATACACGTGATCATTAGAACGCATTTACACGTATTTTTGACGTTGATTTGAAG
 14847  GGCGGTCATACTAAGTGTGGCCCCCATATAAGGGTATGCATTTCAATAGACTCTCAGGGG
 14907  ATTGCGGTCTGGGATACCCTCTTTGATGTCCCGGGCCCCCAGACGGGTGTTCTTGGTATT
 14967  GAGGAAAGGACAATATCGTCCAAAATACTCCGTATTTTTTCAATT
;      G-nad5 ==> start /citation=Paquin_4
;      G-nad5-E1 ==> start
 15012  ATGTATTTAACTATAATTACTTTACCCTTATTTGCTTTTTTAACTGTTGGAGTTATTGGT
 15072  AGAAAATTAGGTGTTAGGGGTTCACAAATAATAACAAGTTTAAGTATAATTATCTCAGCA
 15132  ATATTATCATTATATGGATTTTATGAAATTGTTCTCTTAAATAATTTAGGACCAATAACA
 15192  ATTTATCTGTCACCATGGATGAACGTTATAGGTGCTCATGCAGATTGGGCTTTTTACTTT
 15252  GATTCAATTTCAATTACAATGTGTGTTGTGGTTTCATCAATCTCATCACTTGTTCATCTT
 15312  TATTCAATAGGATATATGCAAGGTGATCCACACATACAAAGATTTTTCTCTTATTTATCT
 15372  TTATTCACATTTTTTATGTTATTATTGGTGACTGGTAATAATTACTTACTTATGTTTGTA
 15432  GGATGGGAAGGT
;      G-nad5-E1 ==> end
;      G-nad5-I1 ==> start /group=I
;      G-nad5-I1-orf261 ==> start /first_codon=D /OMEGA /inframe /pseudo
;      G-nad5-I1-orf261-F1 ==> start  /join
 15444  GATTCACTTTGCCTTATATGGTTAGATCTTTATAACTTTATAACTGGGGTTAATATGGGT
 15504  GACATATTTTATGATCATATTCTTTTAGCAAGTCCATTAATGTCTAGAAAATTTAATTTA
 15564  TCTGGAATTTCAAAAATTTTCAGAAATGTTTTAATTTCTTTCAGTTCAATTGCATTTGAT
 15624  CCAGATTTAATTTCTGTCATTTTTGGCTCATTATTAGGAGATTCTCATTTGGAGAGACGA
 15684  TCAGCTACTGGTGGATCTAGATTGAAGTACTATGTTAGTGCAAAGAATTCAGGGTATTTA
 15744  TTGTGGATTCATAATTTTTTTGCTAAGAGAGGATTATGTTCTCCTAAAATTCCACAAGTT
 15804  AAAACTCAAAAGAGTTCTACTGTAGGGGATTCTTTATCAATTAGTTTTAACACATATACT
 15864  AATATGGCTTTCAACTGGATTCATGATATGTTCTATGTAGTTTGTAGTACCACTGGTAGA
 15924  TATATAAAAAGAGTGCCAGAGAACATATCTGATTATTTGACTCCTTTAGC
;      G-nad5-I1-orf261-F1 ==> end
;      G-nad5-I1-orf261-Mob-DHE12 ==> start
 15974  GAGCCCCCCTTCGGGGGGCTTGCATCCCTCCCTCCGGGAGGGCCGC
;      G-nad5-I1-orf261-Mob-DHE12 ==> end
;      G-nad5-I1-orf261-F2 ==> start
 16020  TTTGGCAATCTGGTTTATGGACGATGGTTCAAAAACCTATAATACATGTAGAATTGCCAC
 16080  AAATTCATTTACTTTGGATGATATTAATTTATTATGCAAAGTGCTTCAGGACAAATATGA
 16140  TATTACAGCTACTCCTCAATTATCTGGTGTGGGGAAAGGGTATATTCTTTATATACATAC
 16200  TAGTTCTTTTGACAAGTTTGCATCTATAGTTAGACCTCATATGCATCCTGACATGTTATA
 16260  CAAGTTAGGAGAATAA
;      G-nad5-I1-orf261-F2 ==> end
;      G-nad5-I1-orf261 ==> end
 16276  TTCATAGTAGATAATACCCTTTTTGAGAACTATCCCCTCTCTGGGGGTGATCTCTAGGTA
 16336  AATCCTTAGTAATCGGAATGGAAAATAAGGATTATGTATTATTTGCGACATCATTGAAAA
 16396  CGGTCAAGGATATTTGCCTATTTTTTCAAGACCGTCGGTCACATTTTTGATCGCTATCGA
 16456  CTGGTGCAATGATGGGTGCCTGAAATGGTGCTTAATGTACAGTCAGAACCGAAGTAAGCC
 16516  ACTGCATGGTATTGTTAGTGACTTATACCAAGGCAACTTAAAGTTGTACAGGGGGATAAA
 16576  GAATAGGCAGATTAAATAATGGAGCGAAGGGGCCCCTCGCGTAGCGAGGGGGACTTTGCC
 16636  AAAACCCCCCGGAGGGGGTGAAAAAAAACCCGGAGGGTTTTTTTTGACCCCCCAAAAAAA
 16696  ATGATATTTTTTTTCGGGGGTTTTCGCTTTTTCCAGTTCTTTATCTCTAAGGTTTG
;      G-nad5-I1 ==> end
;      G-nad5-E2 ==> start
 16752  ATAGGAGTATCTTCATATCTTTTAATTAATTTCTGGTTTACTAGAATTCAAGCAAATAAA
 16812  GCTTCAATGCAAGCAATGTTAGTAAATAGAGTAGGTGATTTAGGATTTGTACTTGGATTA
 16872  TTTGGTATTTTCTGGTTATTTGGTTCTTCAGATTATGATACAGTTGGTATTATTGCTTAT
 16932  AAATTAGATGAACAATATATTACAATTGTTACACTTTTCTTATTAATTGCAGCTATTGGT
 16992  AAATCTGCGCAATTAGGTTTGCATACTTGGTTACCTAGCGCTATGGAGGGT
;      G-nad5-E2 ==> end
;      G-nad5-I2 ==> start  /group=I
;      G-nad5-I2-orf231 ==> start /first_codon=K /OMEGA /inframe
 17043  AAGCGAATATATAGATTGGCTATTTATGTATTAGTTCTTATTACTATAATTAAGATGGAT
 17103  TCACTTTTTTTATCAGGTTATTATTCTGTATTTATGATTACACCTTACCAAAAGGAAGCT
 17163  ATAAATGGCTTACTGCTTTCAGATGGTCATGTGAGAGCTCCTAAAGGTAACGGGAATTCT
 17223  AGAATGGAATTCACATTTAAAGTTTCTGTTTTAGATTTTATCAACTGGATTAAGTTTGAT
 17283  GTTTTAGGTTCTATTTGTACTAAATCCCCTCCCACTCCTTATCCCAAAAGTTCTCCGACA
 17343  CAATATTGGTTTGGTACTAGACAGTTACCTTTTATTACAACTTTACACGGTCTTTGGTAT
 17403  ACATTAAATCCTTTAACAGGTAAATATATTAAAATTGTACCATCGATTGTGGCAGAAGCA
 17463  TTTACTGGAGTTACTTTAGCATTTTGGATTATGGGAGATGGCTTCTGGGAGGCAAATGAT
 17523  AAAACAGTTCTCCTTTGTACAGAGTCATTTACGGAAGATGAGGTAGATTTTCTTATCTCA
 17583  TTATTAAAATCTGAATTAGGATTAGTAGCCGGTAAAAAGGCTCGAGGTTCAGGTTATAGA
 17643  ATTCGGTTCAGTAGATTACCTGATAATATTACCAGACTTCGGGATCTAACTTTACCTCAT
 17703  ATGCATCCTCTTATGATTTACAAATTGGGACTTTAG
;      G-nad5-I2-orf231 ==> end
 17739  GGCCCTCCTAAAATCTCGCTATATGCTGGAATATCCTAAAGATGGGTACTATAGGTACTC
 17799  ATATGAGGGGCCCCCCCCTCTTACTCATAAACTCAACCTCACTTTTTATTAAAGGGGGGG
 17859  TAGGGGCCTCAAAAATGGGCAATCAGCAGAAACCAAAGATATAGAAATAAATCATATTTT
 17919  TAAGTTTTTTAACATATTTTTATATATCATTTTAACATATTTTTATATATCATTTTGAAT
 17979  ACGTCTTAATGTATTTTAACATATCTTCGATCTATCTCATATAACCATGTGTGACTTATG
 18039  GTATTTTATCTATTTTGTATTAACGATTATTTCCATATTTAGTAGGATCCTCAGAGACTA
 18099  CACGCGAGACTGCAGAATGCAGATGATATAGTCCAACCGTGCACGAAAGTACATGGGTTT
 18159  TTTG
;      G-nad5-I2 ==> end
;      G-nad5-E3 ==> start
 18163  CCAACTCCCGTATCTGCATTAATTCATGCGGCTACATTGGTAACAGCGGGAGTATATTTA
 18223  ATATTACGATCATCACCACTTTTTGAATTAGCACCAACTAGTTTAATATGTGTTTGTGTA
 18283  ATAGGATCATTAACTGCTATATTTGCTGCTACAACAGGTTTATTCCAAAATGATTTAAAA
 18343  AGAGTTATTGCCTACTCTACATGTTCTCAGTTGGGGT
;      G-nad5-E3 ==> end
;      G-nad5-I3 ==> start   /group=I
 18380  TATAATTTGTACCATAGCCTCTTTTCACTATATGCTGGAATATCTTAAAGATTTGAAACC
 18440  GCGCAGAGCGCGGTGAAAGCTCAAATATAGAGACCATTCGGTCCGATATAGACAATCAGC
 18500  AGGAAACCAAAGCATAATACTCGCCCCCTAATCCTGATCAGTATCCCTACGGGGGTGTCG
 18560  CGCTAGCGTGGGGGGTGGCTATGAAGGCGAGTCGGGTCCTCAGAGACTATACGTGAAACA
 18620  GGACAATTATAACCCCCGAGGGGGGTTGCCTCCGGGCGACCCCACGAGGGGGTCACCCTC
 18680  CGGTAATTGGGTTTGTCTTGAAGATAGAGTCCATAGACGTTAGAGATGTCGTCGATCAAA
 18740  TG
;      G-nad5-I3 ==> end
;      G-nad5-E4 ==> start
 18742  ATATGGTTTTCGCTTTAGGATTAAGTCAATATGAAGTAGCATTTTTCCATTTATTCAATC
 18802  ATGCATATTTCAAAGCATTACTTTTCTTAAGTGCGGGTTCAATTATACATGCTTTACATG
 18862  ACGAACAGGACATGCGGAAAATGGGTGGATTAGTAAATATTTTGCCATTTACTTATACAA
 18922  TGATATTAATAGGATCATTATCATTAATGGCATTACCATTCTTAACAGGGTATTATTCTA
 18982  AAGATGCTATTCTTGAAGTTGCTTATGGACAATTTTTAGTTACTGGTACATTTACTTATT
 19042  GGTTAGGTACTATAACAGCTACTATAACAGCTTTTTATTCATCAAAAGCTTTAATATTAG
 19102  GGTTCTTCGGAACACCAAATGGATCTAAAAAAATTTATAATACAATCCATGAAGCACCAT
 19162  TAATTATGTCTATTCCTTTATTCTTATTATCAATTTGTAGTATTTTCATCGGATATATTA
 19222  CAAATAAACATTTATCTGTCATTGGTATAGGTTCATCTGGGATAATATCTGGTGGAGTAG
 19282  GGACATTAAGAGATCATTATTTAGGATTTGATATTGAATTTATTTCGACTAGTTTTGGAG
 19342  TTCAATTCTATCCTTTATTTGCTAGTTTATTAGGGATCAGTTTAGCACTTATTGTATTAA
 19402  AAGATCCTAAGAAGATGCATAGTATCGAAAAACCCGAAGGGTTACTGAATACTGTAAATA
 19462  TTACTCGATGGCTTTCTTCAAAATCTTACTGGTTTGACAATGTTTACAATACTGTACTTA
 19522  TATCTGGTAGCTTACATTTTGGTGGTATTTTTGCTAGAGATATTGATAAAGGTTTCCTTT
 19582  CACTTCTTGGACCACAAGGACTTCAACAACTTCTTATTACTATTTCTAGATTCTTTGCTA
 19642  TTAAAATTGATACTGGATTTATTCCTCATTATGCTTCAATTATCATAATAATTCCAATCT
 19702  TTATTATTCTTTCAATTTTTATCTAA
;      G-nad5-E4 ==> end
;      G-nad5 ==> end
 19728  CATAACAGGGGTCCCTTCGAGATGAGTTCTTCCATGAGTTCTTACAGAACTTATGCAAAG
 19788  AGCCCGAAAAAAAAAACCCCCCCTTCGGGGGGGTCATTTTTTTTGGGGCCAACCCCCGGA
 19848  GGGGGTTCGCCCTTCGGGCTCTTTCAAAGAACGGCCACCCAAAGGGTGGTGGGTCCCCCC
 19908  ACGAGGGGTAAAACCCCCCTCCGGGGGGTTTCATTGGTCCCGCCAAAACAAAAAAGACCG
 19968  GGGCGCGTGTCACCCGAATGATCCAAACACCATCTCACTCATGGGGGTTCCCTCTCAGGA
 20028  TCACTTACAGGATGATAAATCAGAAATGTTCAAAAAAGATTGCATAAGGACTGGATCCCG
 20088  GGCAATATTATAGACTTGTGTGATCCCCCCGCACGCGACTTGCGTCGGGGGGGGGGGGAA
 20148  CTTGGATATGGCCTAAAATATGGATTTGTACAATTAGAATAGTTTATAATAAATGATTTC
 20208  AGGAATCTCAATCCTAATCTCGCGGTATCATTGACGCCTGTTCAAGACCTGTGAATATGA
 20268  GACATAGTCGGTATCCTTTTTGGATGATATGAGACCCCTAACCTTTAGGTACATTGATGC
 20328  CAGATATAGTGTCTCAATTGAGATAAACCTGAAATAATCTTAAATGTCTTAAAAAT
;      G-atp6 ==> start
 20384  ATGTTTATAAATTTAAATCCATTAGAACAATTTTCAGTTTATTCAGCAACTTCAGCAATC
 20444  TTAGGATCAAGTTCAAACAGCTTAGCAATTACATCACTCACAAATATTGCTATTTTATTC
 20504  ATAATTGGTTTATTAGTTTTAACAATCTTCCAAATATCAGCTTCATCACATTTAATTAAA
 20564  CCAACAAGATGGAATATAGTTTTAGAAACATGGGTAGCATCAATTTTAGGTATCGTTAAA
 20624  GATCAAATAGGAAATGATGCCAAAAATAGTTTAATTTATTTCCCATTAATATTCACATTC
 20684  TTTAGCTTTGTGTTTATTTCTAATATTTTAGGTATGATTCCTTATAGTTTTACACCAACA
 20744  AGTCATATTAGTGTAACATTAGGCTTAAGTATTGCTATTATGATCGGAGTTACTCTTATA
 20804  GGTTTTTCTAAGCATCAACTTGATTTCTTCAGTCTTTTCGTGCCTAAAGGGACTCCATTA
 20864  GCCTTAGTGCCATTATTAGTGCTCATTGAATTTATCTCTTACTCAGCTAGAGCATTCTCA
 20924  TTAGCTCTTCGATTAACTGCTAACGTATCGGCAGGTCATTGCCTTTTTGGC
;      G-Mob-ama1 ==> start  /GIY-YIG /citation=Paquin_1,Paquin_2
 20975  GTAATTAGCGCCCTCTCTGTATCAGCATGTATAGCAGTATCAAGCTTATTACTTAAAGGT
 21035  ATAACTATTACTTTACCCCTTGCAGTATTAGTTGTATTATATGGTTTAGAGTTATTAGTT
 21095  GCATTATTACAATCATATGTCTTCACGTTACTTACTTGCAGCTATCTTGCTGATGTCGTG
 21155  AATATGGGTGATCATTAA
;      G-atp6 ==> end
 21173  TTGCCCCTTATATTTAACTTAGACATATTATGAGAAATAATAATAGCAGATTTCTTGTAT
 21233  GGGGGTTTTCAACCCCAGGGTTTTTTAATTTGGTGTACATAGATCTTAACAAGTTTGAGG
 21293  GGTTATTCCCCCCCCTTAATAGGAATGGTAAGTTACCCTCAGGAATCAATAAATTATCTT
 21353  TAAGGGTTAGACAG
;      G-orf360 ==> start   /ymf=52   /GIY-YIG
 21367  ATGTCAACAATGGCAGAGTCTAGGGATAATTTAGCTGTACCTGTCGGTGAAATTACACCT
 21427  AAAGATGATTATATTATTAAAGAATTTTATACTTTAACTAATCTTGAAAAAGATATTAAA
 21487  TCTTTTGTTCGAAAGCATGGTAATACTGGAGTTTACATATGGATTAATAAAGAAAATGGA
 21547  AAAAGATATGTAGGTTCTTCAATTAATCTTGCTAATCGACTGAATTATTATTTTATCTTA
 21607  AACTTCAATGATAACAATTTAGCCGTTAGAGCATTAGCTAAATATGGATTTGAGAGTTTT
 21667  AGATTAGTTTTAATATTAATGCCAAATTCTGATATAAGAGAAGTTAGGGGTTTAGAACAA
 21727  CACTTTTTAGATAATTTTGTTATGCCTTATAATGTTGCTATGAATGCTCTTGGTTTTTCT
 21787  TCAGGTGAAAATCATCCTAATTATGGGATAGGAGTATCAAAAACTGCATTAGAAGCTTCT
 21847  AGTTTAGTTAGATCAGTACCAATATTTGCTTATGATTATAATGGGGAATTTATTGGTAGT
 21907  TATGATTCTATTGATAAGGCTTCAAAAGCTTTAAATGTAATAAGCAAAACTATCAGTCAA
 21967  AATAGAGATACTGGTAATCTTGTTTATAATCTTTATTATTTTTATTCTACTGAACAAACT
 22027  CATATTGATTTAAAACCTGTACCTGAAAAGGTTAATGGTTTAGCTGAACTTGTATTTGCT
 22087  TATGATATTGATGGTAATTTAATTGGTAAATATAGTTCTGGAGGTGAAGCTTCTAAAGCT
 22147  CTTGGTGTAAGCACTAGTTCTATTAATAAGGGGAAAAATACAGGTAAACTTATTTCGAAT
 22207  AAGTTTTGCTTTTTCTCAACTGAACAAGAAACTCCTTTTAAACCAATTCCTCCTAAATTA
 22267  CCTGGTAAAGCTAAGGCGACATTTGTTTATGATAGCGACAATAATTTTGTTGGAGAATTC
 22327  GGATCTGTTAGAGCAGCTGCTAAAGCTTTAAATATACCTAAATCAACAGCAAATGCACAC
 22387  GTCGATGATGGTTATCTTATTGGAGGTAAATATTATTTTTATTCAAGTAAAAAAGAATAA
;      G-orf360 ==> end
 22447  TATTTTCGGAGGGCACTTAGTGTATAATGGTTCTAATATAGATATT
;      G-atp6_C ==> start   /first_codon=V /pseudo  /note="carboxi-terminal atp6 sequence" /synonym="atp6*C"
 22493  GTAATTAGCATGCTTAGCGTGTCTGCATGTATGGCAGTATCAAGTATCTTGTTAAAAGGT
 22553  ATAACTATCGGATTACCATTAGCCGTATTAGTGGTACTTTACGGTTTAGAGTTATTAGTT
 22613  GCGTTATTACAATCATACGTGTTCACTCTCTTAACTTGCAGCTATTTAGCTGATATTGTG
 22673  AATATGGGTGATCATTAA
;      G-atp6_C ==> end
;      G-Mob-ama1 ==> end
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 46025  ATGTTATCAACACTTATAATACTTCCATTAGTAGGAGCATTAATAATATATTTAGGAGAA
 46085  TCAAGTTTCACAAATGAGACTCGATTGAGAATTGCACTTATAATAGCAGGAATAAATTTT
 46145  ATAATATCAATAGGATTATGGATTCAGTTTGATGAAAATACAGCACAATTCCAATTTGTA
 46205  GAAGATTTTGGTAGTCTTTTTGGACAAGGATTATGTCATTTGATTATAGGTGTAGATGGT
 46265  ATATCATTATTCTTCGTTATATTGACGAGCTTTTTAACTATACCAATTATTTTAACGCCA
 46325  CCTTATAATGGTGAGTCACCAACAGCCTATTTAATAACTCTTCTTATTCTTGAAAGTATG
 46385  TTAATTGCAGTATTCGTGGTGTTAGATTTATTATTATTCTATATTTGCTTCGAAACAGTA
 46445  TTAATACCTATGTTTCTTATAATAGGAATATGGGGGTCTAAAGTACGGAAAATAATGGCA
 46505  GCATACCATTTCTTCTTATATACATTATTAGGTTCATTATTCATGTTATTAGGTATCATA
 46565  GTAATCTACTATCAGACAGGTACAACAGATTATCAGTATTTATTAGCTGTTTTAGGGACG
 46625  GCTGAAAGCAGCTTGACTAGAGAAAATCTTTTATGGTTAACATTCTTCTTATCATTTGCA
 46685  GTTAAAGTGCCTATGTTCCCCGTATACGGCTGGTTACCATTAGCACACTCAGAAGCACCT
 46745  ACTGGAGGTTCAATGATATTAGCAGGTATTTTATTAAAACTTTCAGGTTATGGATTTTTA
 46805  AGATATTCTATACCATTATTCCCAAATGCTTCTAATTATTTTACACCTTTTGTTCTTACA
 46865  TTAGCTGTAATTGGTATTCTTTATAGTATTTTTGCTTGTTTCAGACAGACTGATCTCAAG
 46925  TCAGTGATAGCATATTCTTCTATTTCTCACATGAATATTGTAATAGCGGCGATTTTCTCA
 46985  GATAATATAATTGGAATAGAGGGTGCATTATTTATGATGATTAGCCATGGTATTGTGTCT
 47045  AGTGCATTATTCTTTTGTGTCGGTGCATTGTATGATCGAACTGGAACGAGAATTTTAGCC
 47105  TACTACAGAGGTTTAACTATGGTAATGCCATTATTCTCATTATGTTTCTTCATCTTGATT
 47165  TTAAACAACATGGCAGTGCCCGGTGGGATAGGATTTATTGGGGAATTCTTATGTTTCTTA
 47225  GGTATTTTTAAAACTAATCCTATAATTTGCTTATTGGCTTCTCTTAGTATTGTTTTAGGT
 47285  GCTGCTTATAACATTTTCCTCACAAATAGACTTCTTTTTGGTAGTCTTTCTAAATATTTC
 47345  AAATCATATAATGATCTTACAAGAAGAGAATTTATGATACTTTTACCATTCGTTTTCTTA
 47405  TCAATTCTTCTTGGATTATGTCCAAATATTATTCTTAATGCTATTCATCAAAGTTGTTCA
 47465  ATATTCTAA
;      G-nad4 ==> end
 47474  GACATGACGGTCGCCCGTCTTTCTTGATGAACACTGCCAGCAGTGGATAGAGCATTATTG
 47534  T
;      G-trnM2(cau) ==> start /note="fmet initiator"
 47535  CGTGGGATAGAGTAATGTTAACTCATTGGGCT!CAT!AACCCAAAAATGGGGGTTCAATTCC
 47595  CTCTCCCGCAA
;      G-trnM2(cau) ==> end
 47606  ATAAATCGTTCCGTTAGAACGACTTTAATGACCTTGTTTTGCAAGGTGAAATTGAGGAAT
 47666  CAAAAGATAGTTGATCGTAGGGGTAGTAGAAGAGATATCAATTGATTAGAGAACCCTCAA
 47726  TAGGGGTTCCGAAGAACCCTCAGGGGCCTCGCGTAAAGCGAGAATTTATTCGGTGAAGCG
 47786  GAGGGCCCCTCGCGCAGCGAGGGGGGCTTTTCACTCTCACACCATGATGGCGGGTGTACC
 47846  GGGTTGATGATTTCCCGACGAGATTTTCAACAATGGTACGACCAACCAGGTTGAAGATAA
 47906  GGTACTGTGTTGTATGAGATATTGGGCCTTATTCAAAAGACAGGATATCCTTTGGCGGAA
 47966  TTCTTTGGAGTCCAAAAAGGACCTCAATCGAATCATCAGGATCTGCGGACTCGAGATCGT
 48026  ATGATGGCATGAGGTTATCCTTGTAATCTAGAGCAAATTCAAGACCTCAAA
;      G-nad1 ==> start
;      G-nad1-E1 ==> start
 48077  ATGTTACATTGGAATCTTAACTTTATTATAAGTGCTATAGCGCCTTTGTTAATAGTAATA
 48137  TTGAGTATTGTTGTTGTTTTATTAGCAGTTGCATATGCCACATTAGCAGAAAGAAAAGTA
 48197  ATGGGTAGTATGCAAAGACGATTAGGTCCGAATAAAGTAGGTATATATGGACTTCTTCAA
 48257  CCGT
;      G-nad1-E1 ==> end
;      G-nad1-I1 ==> start /group=I
 48261  TAATAGGCTAGCGGCATTGTTTGAGTTCTTGTTCCATGAGTTCTTTAGAACTTATGAAAA
 48321  TTTTGTTTATCAAAATTTAAGAACGAAGGGGCCCCCCAACCGGCACTTTGTCAAAAGCCC
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 48441  TAGATACGAGAATATTCAGGGTCATTTAGTATTAGGACTTTTTGATCTCTTCCGTGAAAA
 48501  TTCTAAATATGTTACAATGGATAATCAGCAGGAAATTAAAGATACAAGAGATCGAGTAAG
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 48681  TATTCTTCACCTAGATCTACGGCCCCTTAATG
;      G-nad1-I1 ==> end
;      G-nad1-E2 ==> start
 48713  TAGCCGACGGGGGTAAATTATTGTTAAAAGAGACAGTTATACCATCACATGCGAATTTAG
 48773  GGCTTTTCTTATTAGCACCTATTCTTACTTTAATTTTTAGTTTACTCGGGTGGATGATCA
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 49073  TGATTTCTCAAAAAGCTATTTGGTACATTATTCCATTAGCTCCTTTGGGCATTATGTTCT
 49133  TCATATCGGCTTTAGCTGAGACAAATCGGCCACCTTTTGATTTACCTGAGGCT
;      G-nad1-E2 ==> end
;      G-nad1-I2 ==> start  /group=I
 49186  AAAGTATAAAAAGAAAAAACTCTTAGATTTGGCCTCATTAAATTTCGCTATATGCTGGAA
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 49366  TATGGCATTCAGTATATATATTTAGAATAGTATTCACATGAATGCTTCATGTCTGTGTTT
 49426  AGTATATTCTTTATACATATGTTTTATATGTGTTAAGGGATACTATAAAGGATCCTCAGA
 49486  GATTTTACGCGAAATATTTTTAAGCCATAATAATAGGAATATGGTTTTAAAGATAAAGAT
 49546  AG
;      G-nad1-I2-orf301 ==> start   /first_codon=N /GIY-YIG /note="no ATG start codon"
 49548  AATCCTGCCCTTCATGAAAGTGAGGGGGAATACATACATCAGAAATTTTTAGATTTTTTT
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 49788  AATAATAAAACAAATAAAATCTATATTGGTAGTGCAGTTAATTTACACAAAAGATTGGTT
 49848  GAGCATCTTTATTCGGATAAGACCAACATTAGATTGCAGCGATCAATTGGTAAAGATGGA
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 49968  TTTATAGATTTTAATGATCTTCTCTTAGAGTCTGAAACATTCTATATTCAATCAATTAAT
 50028  CCAGATTTTTTATATAATTTTAAATTGCATGCTACTTCAAGTGCTGGGTATAAGCACACA
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 50208  CCTATGTTTGGTAAAAGTCACACAGATGAGGCGAAAGCCAAAATCAGTGCTAAAAAATCC
 50268  AAAATTAGAGTATTAATATTAGATACCCAATCAAATACTGTTGATATATTTGATAACACT
 50328  GTTTTAGCTAGCGAATTTATTGATGTACATAAAGGCACAATATCAAAAAATATTAAATCT
 50388  GGTAGATTACTTTATAATAGATACTTAATCTTAAAAATTTTTGATGTTGATGTAGATATA
 50448  ACTTAG
;      G-nad1-I2-orf301 ==> end
;      G-nad1-I2 ==> end
;      G-nad1-E3 ==> start
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;      G-nad1-E3 ==> end
;      G-nad1 ==> end
 50796  ATTGTTTGGACCAAAATGAAAGATAACTGAAATTGGCCTCATGTCGACTGAAGTGAGCTA
 50856  TCAGTTCAATCTTTCTATCGGGACCCCCCTACGGGGACCCACGCACACCCCCGAGGGGGT
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;      G-trnD(guc) ==> start
 50927  TGGGTATGTAGCTTAATAGGTAAAGCCTCAATTT!GTC!GAGTTGGAAAATGCGGGTTCGAC
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;      G-trnD(guc) ==> end
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 51362  TTATTAG
;      G-nad4L ==> start
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;      G-nad4L ==> end
 51669  AGAGTTTGTTACAAACTGTCGGATTCAGAACTCCTATGGAGTCATCTCTAATGCGACCCA
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;      G-Mot-DHE58 ==> start
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;      G-Mot-DHE58 ==> end
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 51872  ATCTAGAAACATTTCTTTCCATGATTCTCCGATTAAGTTAAAACTCAATCGAGGAACCAC
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 52112  ATTGGTTGGGTGTCCGGGAATCAATATAATCAGAAAGATTTATCTTTCTATGACTAAGTT
 52172  AAGAAGTTCTATCTGGATTCGCAAGGGATTCCAGCGAAATAAGAACGTAAGATAATAAGA
 52232  AAATATT
;      G-atp9 ==> start
 52239  ATGATCGCTAGTGCAAAAATTATCGGAGCTGGACTTACAACAATGGGATTAGCAGGTGCA
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 52419  TTATTCAGCTTAATGATGGCATTTTTATTATTATACGCAGTATAG
;      G-atp9 ==> end
 52464  TTT
;      G-orf107 ==> start /ymf=53  /note="/GIY-YIG orf, when joined to orf211 via frameshift"
 52467  ATGTTTAGTAGTTTTAGTTATACATACACATTCCTCCCGAAAGGGGGGAATAAAATTAAG
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 52587  AATTATTTTTATTTTTTATTTTATTCTGATGTTAACAACGAAGATTCAGATATTGGTTTA
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 52707  CCCGAAGGGGATGATGATAGATTTATTTATGAATTTGATTATTCTAAATTAGGTGGGATT
 52767  AAACCTGTATACCATTTATTTTAG
;      G-orf107 ==> end
 52791  AAATTTTAATGATATTTCTTCTATAACTACTAATTTAGCTGGTGTAGCTGGAATTTATCT
 52851  TTGGCATAGTCGAATAACAGGAAAGGTTTATGTAGGTTCATCAGTAACTTTAAGAAAAAG
 52911  ACTT
;      G-orf211 ==> start /ymf=54
 52915  ATGCAATATAATCAACCAGTTTATTTAGCTACAAACAACTCACATTTTGTTAATGCAATT
 52975  AAAGTTATCCCTATTAATAGTTGGGATTTACTTATCTTAGAAACATTTGATTTGTCTAAA
 53035  GAAAAATATGATGCTATAATCTCTAAAGAAACAGAGTGGATTAAAAAATTTAGTGAAGAC
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 53155  GAAACAAAGGCAAAGATGAGTGAATCAAGAAAAGGAAGAACCCCAATGCTTGGAAAAACA
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 53275  TTTGGAAAAACACATACAGAGGAAGCAAAAGCAAAAATTAGTGCATCTAGATTGGGTAAA
 53335  CCATTATCAGATGAAATAAGAGCAAAGATGAGTGCTAATAGTTCGAGATCAAGGGTAGTG
 53395  TATAAAATTGACGATAATACGAAAGAAGTATTAGCGACATATGTTTCAAGAAAAGCAGCT
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 53515  GAAAATGGGGTATTTTTCTCTTATGAGAAGGATTAA
;      G-orf211 ==> end
 53551  AGGAATTAAAATTGTACGTTTTCATCTTTTCCCTTCGGGCCCCCCCCTCATTGGGGGGTT
 53611  TTCCTCTATATTTTGATATGCTATTTCAGCTATTATTTTGTTGATTTAAGGGAGGGGTAA
 53671  CTATTATTTGACTGATCGGGTGTAATTAGAAAGATTTATCTTTCTGTGACTAAGTTAAGA
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 53791  ATT
;      G-orf204 ==> start /ymf=55  /note="hybrid orf with atp9 N-terminal"
 53794  ATGATCGCTAGTGCAAAAATTATCGGAGCTGGACTTATATCGATTGGATTAGCAGGAGCA
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 54214  TCATTAAAGTTATTCCTCACTTCTTTTAAGTGGGATGGTGTAAATATCCCAGAAGACAAG
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 54394  GGGGACAATTAG
;      G-orf204 ==> end
 54406  TCCCTGTCCCCGAAGGGGGACCTTCATAATGCCCTATACATAAAAATGTCGGGATCTATA
 54466  AAGAGAGAGAGATAGATAAAGATAGATAGAGATAGAAAAAATAAAAGTCAATTTGACACC
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 54586  CCGGGCGGGTCCTTGTGAAGAACCCCGAGCGCAGCTCGGGGGACTTTACCAAAACCCCCC
 54646  CGAAGAATATCTAAAAGATATTCTTGGGGTGGGTCAACCCCCGAAGGGGGTGAACCCCCC
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 54766  CTACCCTGGGGTCGAGGTCGAGATACCACCAGAAGGTTGCTATGCAACATCTTGTCGCTC
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 54886  GTGTCTAGAGACTTAGTAAAACTAAGTTTCGGATTCTGAACGGAATCTATTTCATGTT
;      G-trnL(uaa) ==> start
 54944  TGTCTACTTGGCGAAATTTGGCATACGCCGGGAAATT!TAA!AATTTCTTACCGAGAGGTAC
 55004  TGGTTCAAGTCCAGTAGTAGACAC
;      G-trnL(uaa) ==> end
 55028  TGTAAACCAATTCCGGAGGGGCCCCCGGTCATGACGGCCCTACGGGAAAAATGCCTTACC
 55088  GAGGGGTGCAGTGATTTTACTTCACTCATAGACAAATCACTTGAAGTCGAATTATATACA
 55148  CAACTTAACATCTCTTCGAGATGTGTCCGCTCTT
;      G-trnQ(uug) ==> start
 55182  TGGGCTGTAGCCAAGTTGGAAAGGCAGCGAGTT!TTG!ATCTCGCCTATCGGTGGTTCGAGT
 55242  CCATTCAGCCCAT
;      G-trnQ(uug) ==> end
 55255  CTAACCGTAGGTAAATTGAAATTGGTATGAGACCAACTGAAGTCAGTCGAAGACTAGTCC
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 55615  GAACTGAGAGTTGGCGTCAAAGATCGCATCTCCCGTG
;      G-trnF(gaa) ==> start
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;      G-trnF(gaa) ==> end
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;      G-rps3 ==> start /note="no transcript detected"
 56075  ATGTCTAGACATCTTAAAAGAGCGCAAAGCGCACATTGGAAATCAAGAAATTATATCTCT
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 57461  TCCCCCCAAATGA
;      G-citation_6 ==> end