LOCUS PKDRPOLYM 7174 bp DNA linear PLN 18-APR-2005 DEFINITION Pichia kluyveri linear mitochondrial DNA plasmid pPK2 encoding DNA polymerase and RNA polymerase. ACCESSION Y11606 VERSION Y11606.1 GI:2370355 KEYWORDS DNA polymerase; RNA polymerase. SOURCE mitochondrion Pichia kluyveri ORGANISM Pichia kluyveri Eukaryota; Fungi; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Pichia. REFERENCE 1 AUTHORS Blaisonneau,J., Nosek,J. and Fukuhara,H. TITLE Linear DNA plasmid pPK2 of Pichia kluyveri: distinction between cytoplasmic and mitochondrial linear plasmids in yeasts JOURNAL Yeast 15 (9), 781-791 (1999) PUBMED 10398346 REFERENCE 2 (bases 1 to 7174) AUTHORS Nosek,J. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (04-MAR-1997) J. Nosek, Institut Curie, Section de Recherche, Centre Universitaire Paris, Batiment 110, 91405 Orsay, FRANCE FEATURES Location/Qualifiers source 1..7174 /organism="Pichia kluyveri" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /strain="CBS 7907" /db_xref="taxon:36015" /plasmid="pPK2" repeat_region 1..548 /rpt_type=INVERTED /rpt_type=TERMINAL CDS 331..3309 /note="ORF2" /codon_start=1 /transl_table=3 /product="RNA polymerase" /protein_id="CAA72339.1" /db_xref="GI:2370356" /db_xref="GOA:O21375" /db_xref="InterPro:IPR002092" /db_xref="UniProt/TrEMBL:O21375" /translation="MKTMNTMMQYNYRPKGQYCLGNFNMFHNMLHNKFVTTNFFELHN VSPYTRIFNGLFLNPHNTRFYTTSHNTNNLVLQHYTAQLDSSNNVDMETKIEKLYTSH DKMINKDLRHLDGINNIFIKNKLTEMSNSIDSSAVNIYENSDMTLTDNILKLMLKYMT IDQFKGMMFNMYYLMTMSSRGSMKMQQGNSMMLKSMKYAVLKNNPPLVETDDEDTNYL KGMTLDENCNEYTMNEKSMSDSQHIMSDMFMMPNYTTRESVNKLGGPDSYMVYELSSD VTTELLSMKKNKKRLTGVKLDSQLPMVCKPKDYESKTMEMKTKNNEVVRNKVIYGGYL LNGDTVYHNMYYSKPSMKMLSKFNDVYMSTMNNLQSVSYKMNKDMLDWIIKNYEKYNL YTPWDTPMAYEHDIFGKEGKRTSKNVVKDCLAKMSKRDLENDMTDMAKSFKNVSKMYF PLRVDFRGRVYAQSVISYQSTDTAKALLDFGEVYKVNMDDVEYLFMSGANAYGLDKKS HMERINWIKTNSVLMYNLDEELMRTADNKLLFVKFCLEYRKYMDALNSQQKYYYSNYM VYVDATCNGFQHMALTLKDPLTCYNVNLANTSKDMSPRDFYTFIKDSVLDNMKDMNMN KNNSVERTLEMGLTRKMMKTMVMIMPYNAGVTTMTKYLEDSLNYMGTYYTADEKDLVC CKGSEENKDSCRYYKSLELNNARSPESKVPENNLANMTLTSKYSAKSLCKCKKIRTYY MDDENKIVSNKDLMFFINVMRKVVSDNFPVMAKFQNYLNNVSEMLSTSDKPVVWSLPT GIQVGQYYKTKHTKKISLSRYRRHTFNISLYDSKMDKSKSRMSLMPNTMHSLDATALI MLAEQMFKNNMNTQLCSIHDCFGAPISEIDTMKKTTSMTYTSIYFNNDYINKFNQDMT NTMYDVVDNYHMTEKNNKLMVTSLTSNSDIKMFPKPSLEWVKDAEFGINKNSVEYRTL METWKDQNLKNSNYFSYMIN" CDS complement(3488..6844) /note="ORF1" /codon_start=1 /transl_table=3 /product="DNA polymerase" /protein_id="CAA72340.1" /db_xref="GI:2370357" /db_xref="GOA:O21376" /db_xref="InterPro:IPR004868" /db_xref="InterPro:IPR006172" /db_xref="UniProt/TrEMBL:O21376" /translation="MKTMNTMMQYNYRPKGQYCLGNFNMFHNMLHNKFVTTNFFELHN VSPYTRIFNGLFLNPHNTRFYTTSHNTNKSYMWNSNSYWEKDLTSVKVMHFDTRDDYN TLLNNITSTHMEGKLFHFTFKHSMYGNVYSSVQILTIDSTFTADLLEKIMTADMKDLM ERYLMETDDDDLKTSVEIKITSTKDYEPVMGSEYLGTVNDFVISNLSTNKSKLDSYVY TKLKSDQALRYLSNVHKNCMLGPNDQCMEMTDCNLNKDFIIELIGFDFLNKNWKKTLD GKKWETCFNKYVDGIWEMRKDIYNYNIYKYKIKYNPNTDKYLFMSPNNDIIVNIDMYW PTNKIYIRRYLQLDDNIDKLDMKLYRTLDKNYKCMISNKNNELLSVLEYRFYKPFGKE KLKREYMNNMMGSFDIETTSGFDHERIMGVSWIMKPLEMLQELSVNDNLKINTTTMTD VTNADMYDESCMYQGYNMLIECLKDMCVKANNYTFYCHNLSGFDSVYIMSALIKYTRV KGSESDITFKIIRREAKVLKMTVRYMDESGKESQMVMLDSLTVLNASLRKTSPLFELE HQKGYLPYDWVSTNTNYMGPIPQSFNDDVKAYLLELFPNGMMNTKMATKTYTDTDVRL LTMIMDKFKNIMYSTARVDLTKCMTISKLALSMYSNMCHDETKKMPLMSSTMDDTFMR KALFGGYNNVINPMADEAYYYDVNSFYPAVAVKYRYPTTKGFDMSYPEGLDYKDFNYP ETTGVLHCEVETPKNLVTGVLPVKDINKGVMYPLGHFLGIWTTVELDYALSLGYKITV YKGMVFNSMESPYKKYMDLFYSRKSNAKGIYRTLYKSTLNNLLGRFSLAPMNYKDAMM DNTTFKMLSLLHNITNMLEMKDFDVKMCHVEKEIKYTPDNMPEYVNKVRNSEFYTNAL KSMNNFVQNTNTLDSSVIMTTFVNAYARIELLKLIINLTDIGYKVYYSDTDSIVVNKP LPEDTVSSTELGKFKTEHVITKGYFMAGKLYYLMTKDGVKVVNKGLNSKLSEKDFIDL YNGFNVTGSQKGTKKNMELGFVKFFDKDTTMTGSFNKRVKTYNYNGDWIGTKPHVYTN MYECDISYWEDTQLTVYKQSNPSLMGDGNC" repeat_region complement(6627..7174) /rpt_type=INVERTED /rpt_type=TERMINAL ORIGIN 1 ggggggggca ctaactttct ggatcatttt gtgtactgtc atggagaggt agtgtcttct 61 tttcgagtta ctattttaac caatttttat atgtggtagt ctaacgcctt ttacatatta 121 gttatatatt ttttgtatgt tactatttag tttttattct taattattaa tatgctttct 181 atatatatct agctcttaaa tagcattatc tcttcaatat attatcctat tcctgtcctg 241 tcctggattt tataatattt taatcctata tattttccta tatggttaat tttttgcgtt 301 aatcaataaa taaagaaaaa agagaaaaat atgaaaacaa taaacacaat aatacaatat 361 aactatagac ctaaaggtca atattgctta ggcaatttta atatatttca taatatatta 421 cataataaat ttgttactac aaatttcttc gaattacata atgtttctcc ttatacgaga 481 attttcaatg gtttattttt aaacccccac aatactagat tttatactac atctcataat 541 actaataatt tagtattgca acattatctt gctcaattag attctagtaa taatgttgat 601 atagaactaa aaattgaaaa attatatcta tctcatgata aaatgattaa taaagatttg 661 cgtcatttag atggtattaa taatattttt attaaaaata aattactaga aatatctaac 721 agtattgata gttcagcagt taatatttat gaaaatagtg atatgctatt aactgataat 781 attttaaaat taatgttaaa atatataact attgatcaat ttaaaggaat aatatttaat 841 atatattatt taatactgat gtcttctaga ggttcaataa aaatacaaca aggaaattca 901 ataatattga aatctatgaa atatgctgta ttaaaaaata atcccccatt agtagaaact 961 gatgatgagg atctaaatta tttaaaaggt atacttttag atgagaattg taatgaatat 1021 ctaataaatg agaaaagtat gtcggatagt caacatatta tgagtgatat gtttataata 1081 cctaattacc ttactagaga gagtgtaaat aaattaggtg gtcctgattc atatatggtt 1141 tatgaattat catcagatgt actaacagaa ttattatcaa tgaagaaaaa taagaaacgt 1201 ttaacagggg taaaattaga tagtcaatta cctatggtat gtaaacctaa agattatgaa 1261 tctaaaacaa tagagatgaa aactaagaat aatgaggttg taagaaataa agtaatttat 1321 ggaggatact tattaaatgg tgatactgtt tatcataata tgtattatag taaaccatca 1381 ataaaaatgt tgagtaaatt taatgatgta tatatatcaa caataaataa cttacagagt 1441 gtatcttata aaataaataa ggatatgtta gattgaatta ttaaaaatta tgaaaaatat 1501 aatttatata caccatggga tacgccaata gcatatgaac atgatatctt tggaaaagag 1561 ggtaaaagac tatctaaaaa tgtagtaaaa gactgtttag caaaaatatc taaaagagat 1621 ttagagaacg atatactaga tatagctaaa tcatttaaaa atgtatcaaa aatatatttc 1681 cctttaagag tagattttag aggtagagtt tatgcacaat ctgttattag ttatcaatca 1741 accgatctag ctaaagcatt attagatttt ggtgaggttt ataaagtaaa tatagatgat 1801 gttgaatatt tatttatatc tggtgctaat gcttatggtt tagataaaaa atcacatata 1861 gaaagaatta attgaattaa aactaatagt gtattaatat ataatttaga tgaggaatta 1921 ataagaacag ctgataataa attattattt gtaaagtttt gcttagaata tagaaaatat 1981 atagatgcat tgaatagtca acaaaaatat tattattcta attatatagt gtatgtagat 2041 gctacttgta atggtttcca acacatagct ttactattaa aagatccatt actatgttat 2101 aatgttaatt tagccaatac aagtaaagat ataagtccta gagattttta tacttttatt 2161 aaagattctg tattagacaa tataaaggat atgaacataa ataaaaataa ttctgtagaa 2221 agactattag agataggatt aactagaaaa atgataaaaa ctatagttat gattatacct 2281 tataatgccg gtgtgctaac tatgcttaaa tacttagaag atagtttaaa ctatatagga 2341 acatattata cagctgatga aaaagattta gtatgttgta aaggttctga agaaaataag 2401 gatagttgta gatattataa atcattagaa ttgaataatg ctagatctcc tgaatctaag 2461 gtacctgaaa ataatttagc taatataact ttaacatcta agtatagtgc taaaagttta 2521 tgtaaatgta aaaaaattag actatattat atagatgatg aaaataaaat tgtttcaaat 2581 aaagatttaa tgtttttcat taatgttatg cgtaaagttg tttctgataa tttcccagtt 2641 atagctaaat ttcaaaatta tttaaacaat gtttctgaaa tattatccct aagtgataaa 2701 cctgttgtat gatctttacc tacaggaatt caagttggtc aatattataa aactaaacat 2761 actaaaaaga tttctttaag tagatatcgt agacatacat tcaatatttc cttatatgat 2821 tctaaaatag ataaatctaa atctagaata agtttaatgc ctaatcttat acattcttta 2881 gatgctactg ctttaattat attagctgaa caaatgttta aaaataatat aaacacacag 2941 ttatgtagta ttcatgattg ttttggagca cctattagtg agattgatac tatgaaaaag 3001 acgctttcta tgacatatct aagtatttat ttcaataatg attatattaa caaatttaat 3061 caagatatgc ttaatcttat atatgatgtt gtagataatt atcatataac tgaaaagaat 3121 aataaattaa tagttacatc attaacatct aatagtgata ttaaaatatt ccctaaacct 3181 tcattagaat gagtaaaaga tgctgagttt ggaattaata aaaatagtgt tgaataccgt 3241 cttttaatgg aaacttgaaa agatcagaat ttaaaaaatt ctaattactt tagttatata 3301 attaactaaa acaataattt gagatttatt acactataca catatatgta tgtatgtatg 3361 tatatgtata ggttaaacaa aaaaaaagat aatagtttta cctattacca aaaaaaacat 3421 ttatgttttt ttttatgtat cgtaagatac attttttttt gtatatattg ctgataagaa 3481 tatatattta acaattacca tctcctatta aagagggatt agattgttta taaacagtta 3541 attgtgtatc ttctcaatat gagatatcac attcgtatat atttgtatat acatgaggtt 3601 ttgtaccgat tcaatcacca ttgtaattat atgtttttac tcttttatta aagcttcctg 3661 ttatagtaag gtccttatca aagaatttaa cgaatcctaa ttctatattt ttcttagtac 3721 ctttttgaga accagttaca ttaaatccat tatataagtc aataaaatct ttttctgata 3781 atttactatt taaacctttg ttaactactt taactccatc tttagttatt aaataatata 3841 acttacctgc tatgaaatac cctttagtaa ttacatgttc aagtttgaat ttacctaatt 3901 ctgtagatga aacaagatct tcaggtaaag gtttgttaac tacaatacta tcagtatcac 3961 tataatatac tttataacca atatctgtta aattaataat taattttaat aattcaattc 4021 tggcataagc atttacgaat gtagtcataa taactgaact atctaatgta ttagtatttt 4081 gaacaaaatt gttcatactt tttaaagcat taagataaaa ttctgaatta cgtactttat 4141 taacatattc gggcatattg tctggtgtat atttaatttc tttttctacg tgacacattt 4201 tcacatcaaa atcttttatt tctaatatat tagtaatatt atgtaataaa cttaatattt 4261 taaatgttgt attatctatt atagcatcct tataatttat aggagctaat gaaaatcttc 4321 ctaataagtt atttaatagt gatttatata atgttctata aataccctta gcatttgatt 4381 ttctactata aaataaatct atatattttt tataaggtga ttccattgaa ttaaagacca 4441 tacctttata tactgtaatt ttatatccta aagataatgc ataatctaat tctactgttg 4501 ttcaaatacc taagaaatgt cctaaaggat atattacacc tttattaata tctttaacag 4561 gtaatacacc agttactaaa tttttaggtg tctctacctc acagtgtaat actcctagag 4621 tttcaggata attaaaatct ttataatcta aaccttctgg ataagatata tcaaatcctt 4681 ttgtagtagg gtaacgatat ttaacagcta ctgcagggta aaatgaatta acatcatagt 4741 aataagcttc atcagctata gggttaataa cgttattata accaccaaat aaagctttac 4801 gtatgaaagt atcatctata gtagaggata ttaatggtat ttttttagtt tcatcatgac 4861 acatattact atatatagat aaagctaatt tagagatagt tatacattta gttaaatcaa 4921 ctctagcagt actgtatata atatttttaa atttatccat aattattagt aataatctta 4981 catcagtatc tagataagtt ttaagagcta ttttagtatt cattatacca ttaggaaata 5041 attctaataa ataagcttta acatcatcat taaacgattg aggaatagga cctatataat 5101 taagattagt agatactcaa tcatatggta aataaccttt ttgatgttcc aattcaaata 5161 atggtgatag ttttcttaaa gaagcattca atactagtaa actatctaat ataactattt 5221 gagattcttt accagattca tctatatacc taacagttat ttttaatact ttagcttccc 5281 ttctaataat tttaaatgta atatcagatt ctgaaccttt tactctagta tatttaatta 5341 aagcacttat aatatatacc gaatcaaatc cacttaagtt atgacaatag aatgtataat 5401 tattagcttt aacacacata tcttttaaac attcaatcaa catattataa ccttgatata 5461 tacaactttc atcatatata tccgcattcg ttacatctgt tataagggtt gtattaattt 5521 ttaaattatc atttacagat aactcttgta acatttctaa aggtttcata attcatgata 5581 ctcctataat tctttcatga tcaaaaccac tagttgtttc aatatcaaaa gaacctatca 5641 tattatttat gtattctctt tttaattttt ctttaccaaa aggtttataa aatctatatt 5701 ctaatacaga caataattca ttatttttat tactaatcat acatttataa tttttatcta 5761 aagttctata taatttcata tctaatttat caatattatc atctaattgt aaatatcttc 5821 taatataaat tttattagta ggtcagtata tatcaatatt aacaataata tcattattag 5881 gacttataaa taagtattta tcagtattag gattatattt aattttatat ttataaatat 5941 tatagttata aatatcttta cgtatttctc aaataccatc aacatattta ttaaaacatg 6001 tttctcactt tttaccatct aaagttttct ttcagttttt atttaaaaag tcaaaaccaa 6061 ttaattcaat aataaaatct ttatttaaat tacaatcggt tatttctata cattgatcgt 6121 taggacccaa tatacaattc ttatgtacat tacttaaata tcttaacgct tggtcagact 6181 ttaatttagt atatacataa ctatctaatt tagatttatt agtacttaaa ttactaataa 6241 caaaatcatt tactgtacct aaatattcag aacctattac aggttcatag tctttaagac 6301 tagtaatttt aatttcaaca ctagttttta aatcatcatc atcagtctct attaaatatc 6361 tttccattaa atcttttata tctgcagtta taatcttttc taataaatca gcagtaaatg 6421 ttgaatcaat agttaaaatt tgaacactag aatatacatt accatatata gaatgtttaa 6481 aaagaaaatg aaataattta ccttccatat gtagactaag aatattattt aataaaagat 6541 tataatcatc tctagtatca aaatgtataa ctttaacact agttaaatct ttttcccaat 6601 aagaattaga atttcatata taacttttat tagtattatg agatgtagta taaaatctag 6661 tattgtgggg gtttaaaaat aaaccattga aaattctcgt ataaggagaa acattatgta 6721 attcgaagaa atttgtagta acaaatttat tatgtaatat attatgaaat atattaaaat 6781 tgcctaagca atattgacct ttaggtctat agttatattg tattattgtg tttattgttt 6841 tcatattttt ctcttttttc tttatttatt gattaacgca aaaaattaac catataggaa 6901 aatatatagg attaaaatat tataaaatcc aggacaggac aggaatagga taatatattg 6961 aagagataat gctatttaag agctagatat atatagaaag catattaata attaagaata 7021 aaaactaaat agtaacatac aaaaaatata taactaatat gtaaaaggcg ttagactacc 7081 acatataaaa attggttaaa atagtaactc gaaaagaaga cactacctct ccatgacagt 7141 acacaaaatg atccagaaag ttagtgcccc cccc // Disclaimer | Write to the Help Desk NCBI | NLM | NIH   Feb 9 2005 14:31:10