Codon usage in Schizophyllum commune mitochondria


Genes counted: atp6 cox1 atp8 atp9 cox2 nad1 cob nad4 nad6 nad2 nad3 cox3 nad4L nad5

Total: 14 gene(s)

Absolute count:


      ===========================================
      F TTT 276. S TCT 150. Y TAT 179. C TGT  31.
      F TTC 140. S TCC   7. Y TAC  52. C TGC   0.
      L TTA 538. S TCA 147. * TAA  13. * TGA  10.
      L TTG  11. S TCG   3. * TAG   1. W TGG  51.
      ===========================================
      L CTT  68. P CCT 107. H CAT  47. R CGT   3.
      L CTC   0. P CCC   8. H CAC  42. R CGC   0.
      L CTA  70. P CCA  57. Q CAA  96. R CGA   1.
      L CTG   2. P CCG   1. Q CAG   3. R CGG   0.
      ===========================================
      I ATT 292. T ACT 132. N AAT 225. S AGT 128.
      I ATC  76. T ACC   9. N AAC  44. S AGC   8.
      I ATA 179. T ACA 119. K AAA 140. R AGA  79.
      M ATG 114. T ACG   1. K AAG   4. R AGG   3.
      ===========================================
      V GTT 109. A GCT 166. D GAT 116. G GGT 101.
      V GTC   1. A GCC  25. D GAC  17. G GGC   2.
      V GTA 178. A GCA  85. E GAA 132. G GGA 175.
      V GTG  26. A GCG   2. E GAG   7. G GGG  16.
      ===========================================

* Percentage count:

      ===========================================
      F TTT  66. S TCT  34. Y TAT  77. C TGT 100.
      F TTC  34. S TCC   2. Y TAC  23. C TGC   0.
      L TTA  78. S TCA  33. * TAA  54. * TGA  42.
      L TTG   2. S TCG   1. * TAG   4. W TGG 100.
      ===========================================
      L CTT  10. P CCT  62. H CAT  53. R CGT   3.
      L CTC   0. P CCC   5. H CAC  47. R CGC   0.
      L CTA  10. P CCA  33. Q CAA  97. R CGA   1.
      L CTG   0. P CCG   1. Q CAG   3. R CGG   0.
      ===========================================
      I ATT  53. T ACT  51. N AAT  84. S AGT  29.
      I ATC  14. T ACC   3. N AAC  16. S AGC   2.
      I ATA  33. T ACA  46. K AAA  97. R AGA  92.
      M ATG 100. T ACG   0. K AAG   3. R AGG   3.
      ===========================================
      V GTT  35. A GCT  60. D GAT  87. G GGT  34.
      V GTC   0. A GCC   9. D GAC  13. G GGC   1.
      V GTA  57. A GCA  31. E GAA  95. G GGA  60.
      V GTG   8. A GCG   1. E GAG   5. G GGG   5.
      ===========================================


[ One level back | OGMP | FMGP | GOBASE | PID | CIAR-PEB | ISEP | CGAT | Comments | WebSearch ]


[ Monosiga | Allomyces | Spizellomyces | Harpochytrium | Monoblepharella | Rhizophydium | Rhizopus | Phytophtora | Schizophyllum | Schizosaccharomyces | Aspergillus ]