Codon usage in Phytophthora infestans mitochondria


Genes counted: rpl14 rpl5 cox2 cox1 atp9 nad9 cob atp1 nad4 nad7 nad2 rps10 rps12 rps7 cox3 atp6 nad3 nad5 nad6 nad4L nad1 nad11 rps11 rps13 rpl2 rps19 rps3 rpl16 orfB rps14 rps8 rpl6 rps2 rps4

Total: 34 gene(s)

Absolute count:


      ===========================================
      F TTT 675. S TCT 145. Y TAT 342. C TGT  80.
      F TTC  50. S TCC   4. Y TAC  27. C TGC   3.
      L TTA 954. S TCA 208. * TAA  33. * TGA   1.
      L TTG  20. S TCG  15. * TAG   0. W TGG  95.
      ===========================================
      L CTT  50. P CCT 168. H CAT 129. R CGT  85.
      L CTC   0. P CCC   4. H CAC  20. R CGC   3.
      L CTA  29. P CCA  80. Q CAA 236. R CGA  22.
      L CTG   1. P CCG  13. Q CAG  12. R CGG   2.
      ===========================================
      I ATT 749. T ACT 212. N AAT 608. S AGT 156.
      I ATC  45. T ACC  15. N AAC  28. S AGC   5.
      I ATA 296. T ACA 183. K AAA 761. R AGA 136.
      M ATG 188. T ACG   7. K AAG  21. R AGG   3.
      ===========================================
      V GTT 212. A GCT 187. D GAT 216. G GGT 308.
      V GTC   5. A GCC  10. D GAC   7. G GGC   8.
      V GTA 152. A GCA 126. E GAA 265. G GGA 118.
      V GTG   8. A GCG  12. E GAG  19. G GGG  19.
      ===========================================

* Percentage count:

      ===========================================
      F TTT  93. S TCT  27. Y TAT  93. C TGT  96.
      F TTC   7. S TCC   1. Y TAC   7. C TGC   4.
      L TTA  91. S TCA  39. * TAA  97. * TGA   3.
      L TTG   2. S TCG   3. * TAG   0. W TGG 100.
      ===========================================
      L CTT   5. P CCT  63. H CAT  87. R CGT  34.
      L CTC   0. P CCC   2. H CAC  13. R CGC   1.
      L CTA   3. P CCA  30. Q CAA  95. R CGA   9.
      L CTG   0. P CCG   5. Q CAG   5. R CGG   1.
      ===========================================
      I ATT  69. T ACT  51. N AAT  96. S AGT  29.
      I ATC   4. T ACC   4. N AAC   4. S AGC   1.
      I ATA  27. T ACA  44. K AAA  97. R AGA  54.
      M ATG 100. T ACG   2. K AAG   3. R AGG   1.
      ===========================================
      V GTT  56. A GCT  56. D GAT  97. G GGT  68.
      V GTC   1. A GCC   3. D GAC   3. G GGC   2.
      V GTA  40. A GCA  38. E GAA  93. G GGA  26.
      V GTG   2. A GCG   4. E GAG   7. G GGG   4.
      ===========================================



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