;; DEFINITION Schizosaccharomyces pombe mitochondrial DNA, complete genome ;; KEYWORDS universal translation code; ;; groupI and groupII introns; intronic orfs; 25 tRNAs; ;; SOURCE fission yeast ;; ORGANISM Schizosaccharomyces pombe ;; Eukaryotae; mitochondrial eukaryotes; Metazoa/Eumycota group; ;; Eumycota; Ascomycotina; Archaeascomycetes; Schizosaccharomycetales; ;; Schizosaccharomycetaceae; Schizosaccharomyces. ;;REFERENCE 1 (bases 1 to 2970) ;; AUTHORS Lang,B.F., Cedergren,R. and Gray,M.W. ;; TITLE The mitochondrial genome of the fission yeast, Schizosaccharomyces ;; pombe. Sequence of the large-subunit ribosomal RNA gene, comparison ;; of potential secondary structure in fungal mitochondrial ;; large-subunit rRNAs and evolutionary considerations ;; JOURNAL Eur. J. Biochem. 169, 527-537 (1987) ;;REFERENCE 2 (bases 3131 to 4580) ;; AUTHORS Trinkl,H., Lang,B.F. and Wolf,K. ;; TITLE Nucleotide sequence of the gene encoding the small ribosomal RNA in ;; the mitochondrial genome of the fission yeast Schizosaccharomyces ;; pombe ;; JOURNAL Nucleic Acids Res. 17, 6730 (1989) ;; STANDARD full automatic ;;REFERENCE 3 (bases 4666 to 8923) ;; AUTHORS Lang,B.F. ;; TITLE The mitochondrial genome of the fission yeast Schizosaccharomyces ;; pombe: highly homologous introns are inserted at the same position ;; of the otherwise less conserved cox1 genes in Schizosaccharomyces ;; pombe and Aspergillus nidulans ;; JOURNAL EMBO J. 3, 2129-2136 (1984) ;; STANDARD full automatic ;;REFERENCE 4 (bases 9973 to 13974) ;; AUTHORS Lang,B.F., Ahne,F. and Bonen,L. ;; TITLE The mitochondrial genome of the fission yeast Schizosaccharomyces ;; pombe. The cytochrome b gene has an intron closely related to the ;; first two introns in the Saccharomyces cerevisiae cox1 gene ;; JOURNAL J. Mol. Biol. 184, 353-366 (1985) ;;REFERENCE 5 (bases 1 to 19431) ;; AUTHORS Ahne,A., Muller-Derlich,J., Merlos-Lange,A.M., Kanbay,F., Wolf,K., and Lang, B.F. ;; TITLE Two distinct mechanisms for deletion in mitochondrial DNA of ;; Schizosaccharomyces pombe mutator strains. Slipped mispairing mediated by ;; direct repeats and erroneous intron splicing. ;; JOURNAL J. Mol. Biol. 202, 725-34 (1988) [89011997] ;; FEATURES ;; source ;; /organism="Schizosaccharomyces pombe" ;; /strain="ade7, 50h-" ;; /mitochondrion ;; /shape="circular" ;; /sequenced_mol="DNA" ;; /complete ;; /translat_table=1 ;; BASE COUNT G=3066 A=6561 T=7022 C=2782 ;; ORIGIN 5' of rnl gene > S.pombe mtDNA; 19431 bp ; G-rnl ==> start 1 AATGTGTAATTTGAATCAATTTCTATCCTTTTAAAAATACATCATAAAGTGTACTTTTTT 61 AAGGATTTAGTTATTAAAGGATTAATTATGGATTGCTAACCAGTTAATATTAAGAGGAAG 121 CTTTTAAAGCTTAATTCAGCAATTTTTTAATTGTTGTTTCTCCTAAAGGTAAACCACTAA 181 AAAGAAAGAACTTCGGGTTTTTCTTTAAAATAAACTAGAGGAACTGAATCATCTTAGTAC 241 TCTAAGGAAAATAAAATAACAATGATTATTGTAGTAGTGGCGAACGAATCATTAATAGTC 301 TAACTTATAAAAATATTAAAAAAAATTTTTACCAAAGAAGAGAAAAATGGGTTCTTCATT 361 TTTAATAAGTAATAAGTAATAAAGTAAAATGGGAACTTAACCTGTTTGAATATTGGAGAA 421 CCAATCTCCAAAGACTAAATATATTAACTGAGTGATAGTGAAGAGTACCGTAAGGGAAAG 481 CAATGAAATAGTTAATCTATAAGCGAAGATAGTGAATTTTAAATAAATTATTATCTTGTA 541 CCTTTTGCATAATGGGTCAGCAAGTTTTAATTATTTGCAAGCTGAAAAGCCATAAAGTAA 601 ATAATTAAAGACCCGAAACCTGACGATCTTACCATGAACAGATTTTAAGGATCGAACCAG 661 TAATCGTTGCAAAGATTTTGGATGATTTGTGGTAAGGGGTGAAATGCTAATCGAGTTAGG 721 TGATAGCTGGTTGTCCACGAAACCATTTTAAGATGGGCACTTCAAAAACTAAATGAGGTA 781 CAGAAATTTATTGCCTTCAAGAAGTTTTTTCTTGTTAATAGGGGATCTAAAGATTTACCT 841 AAGGCGTTAATTAATCTCGGAATAAATTTAAAAAAGTTTGAAGTAGTTAGACAATTGGCG 901 ATAAGGTCAATAGTCAAAAGAGAAACAGCTCAGATCAAAGATTTAAAGTTCCCCAATTTA 961 AGTTAAGTGATTTAAAGATAGTCTTACTCCTTATTCAATAAGAATATGGGCTTGGAAACA 1021 GCCATTATCTAAGGAGTACGTAATAGTTCACTTATCCAAAAAAAATAATATTTTCTGGAG 1081 AAAGGCATCAAAAATTTAACGGATCTTAAACTTAATACTTAAACTTTGGCAGTATTTTAA 1141 AAATACTGGGTAGTGGACCGATCTATATAAAGATGAAGATGAACTTTTAAGTTTATTGGA 1201 TTTATTAGATGCGAGAATGCTGACATAAGTAACGTAAAAAAAGGTCAAATTCCTTTTCAC 1261 CGAAAACTGAAGGGTTTTGACTTAAAAAGCTTAGCTTAAGTCAAATAAAGTAACAATCTC 1321 TAAGCTAATAAATAGTGATGAGTAAATCTTAACGGATCTTAAAATAAAAGTTTTATTGAA 1381 TAGAAATTTTTATTCAGGAAAATTATCCGTTATTTTAATTGTACCCTAAACCGACACTGG 1441 TCAGTTAAGAGAATATCTTAAGGTGTTGAGAGAACTATGCTTAAGGAACTCGGCAAATTA 1501 GCTCTGTTACTTCGGTATAAAGAGTGTTCATTATTTTATGAACTCAATAAAGAGAACCCT 1561 ACAACTGTTTACTTAAAACACAGCACATTGCCAAAATTAAAAAATTATAGTATAATGTGT 1621 GAGGTCTGCTCAATGTCCTATGGTTAACAATACGAACTTTAACGAGTTTTACGGAACCCA 1681 GGATAAATAGCGGCTTTAACTCTGAGGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCCGATAAA 1741 TACGGTCCCGCATGAATGACTTAATGATAGGGTTGCTGTCTCAAGCACAGACTCAGTGAA 1801 ATTGTAATTGCTGTGAAGATACAGTGTTCCCTCAGCTAGACGGAAAGACCCTGGCAGCTT 1861 TACGATAGTTAATTATTGATTAAAGAAAAAATCATCCAAAAGGTGATCTCTTCTTTCTCG 1921 CTTTATCTATTTTTGTTCAGTATAGAGGTTAGTCGTTTAGACAAAAATGAGATATCCTCC 1981 TTAAATAATAAAGATCTTTAAAGTTTAAACTTGACATTAATTAATTGATCGTTTCTGTGG 2041 GGCGCAGGCCTCATAAAAAATAACTGAGGTATCCTAGATCTATATAATTTGTCTAGAAAT 2101 CAAAGTATCCAGAAACATTTTTTAAGTGTTTCTTAATTAAAGATACATGACGCATATAAG 2161 CATAAATAGGTTAAACTGAAAGACTAACAAGTCGCACAGATATGTAAATAGGGTTAAATG 2221 ATCCACATTGAAACACTAATTTAGTGTTTGTATGGAAAACAATGTGCTCAATGAGCGAAG 2281 TTACGCCAGGGATAACAGGTTAATAGAGAGCTAAAGTACAAATCAAATTCTCTGTTTGAC 2341 ACCTCGATGTCGACTCAACCTATCTCCGGTTGTAGCAGATTGGAAGGGTTAGACTGTTCG 2401 TCTATTTAAAAGGTTACGTGAGTTGGGTTAAATCCGTCGTAAGACAGGATGGTTCCTATC 2461 TACTGAGGGAAAAATAAGCAAATTAAAATTTATCTTTTGTACGCAAGGATTTAGATAATT 2521 CAATCTCTAGTTTAACTATTGTTACTTAAATAAAAGTACTTTATTCAAAAGTTAAAAATT 2581 AAGTAGCACGGTAGTAAAGCCAAATTGAACAAATTAAAAACTGAAAGCATCTCAAGTTTG 2641 AAATTTATTTAAAGAGCTTATATTAAGAAAGTAGAAAACTTTCCAAAAGGACATCCTTAG 2701 GATGTACAAATCCTTATTTTAGTAAATCATTGTTTAGATAGATTTAGTTAATTTTTTAAC 2761 CAAAGGGATTATCTCTTTGCTAATTTTTTAAATAACTGGAAATTGCCTAATTACACAATT 2821 TT ; 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G-cox2 ==> end 19308 CCTCCCCCCTAAAGTGTTTATTAAATGATGAACTCAAATAGAGAATAATCAAGTTAAATA 19368 ATAGTAAGATAAGTACTAAATTAGATTTTATAAAATTCCAAAGTATAAATATTTT ;; main promoter ==> start 19423 TATATATGT