Présentations orales, le 12 et 13 juin

ASSEMBLAGE
1- Rodolfo ou Jonathan : Overlap-layout-consensus and De Bruijn approach for genome assembly.
2- Rodolfo ou Jonathan : Assembly softwares/packages for long and short reads in prokaryote and eukaryote genomes.

RNA-SEQ
1- Souhila : Les principes et techniques de l'ARN-Seq.
2- David : Preliminary Analysis of RNA-seq Datasets.
[Reporté 3- Elise : Transcript quantification and differential gene expression : analysis of RNA-seq data.]

VARIANTS
1- Armande : Aspects bio-informatique du séquençage de nouvelle génération pouvant influencer la détection de variants.
2- Marc : Approches bio-informatiques pour la détection de variants à partir de séquençage de nouvelle génération: modèles et algorithmes.
3- Sarah : Comparaisons de méthodes de détection de variants et applications des variants dans la génétique moderne.

PROTEOMIQUE
1- Mélissa : L'approche protéomique.
2- Matt : L'étude protéomique des superstructures dans E. coli à l'aide des outils bioinformatiques.

PHYLOGENIE
1- Honoré : Introduction à la phylogénie moléculaire (généralité, définitons, utilité de la discipline, principales méthodes, exemples d'application).
2- Moulaye : Inférence phylogénétique : méthode de parcimonie.
3- Steven : Inférence phylogénétique par la méthode du maximum de vraisemblance.

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